Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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20
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.19
5582717--5582770
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2.6
20
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3
0
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21
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0
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35
1.47
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21
2.5
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60
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1
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1.28
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2.9
34
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1.50
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26
4.2
26
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168
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1.76
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27
2.8
26
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4
87
35
20
12
32
1.89
5619725--5619787
26
2.4
27
86
5
85
31
22
14
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
23
37
1.94
5619888--5620002
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2.2
53
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22
23
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1.94
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184
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4
24
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1.76
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26
2.8
26
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4
87
34
22
12
30
1.91
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4.2
27
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16
23
23
36
1.94
5626601--5626715
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2.1
54
88
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169
16
23
23
36
1.94
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2.0
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10
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0
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30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5656798--5656871
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18
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13
22
31
1.93
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35
1.9
35
90
0
109
32
11
23
32
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15
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30
0
0
69
0.89
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2
33.5
2
84
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89
46
1
3
49
1.27
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4
9.0
4
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0
54
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0
19
0
0.71
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2
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2
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2
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1.32
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19
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17
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2
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18
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0
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0
0
42
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10
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37
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0
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15
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20
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50
2.5
51
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5
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35
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31
5.8
31
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1
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26
19
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26
1.99
5704432--5704609
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26
1.99
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0
4
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0
1
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0
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14
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21
1.90
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93
2.8
92
87
1
346
41
15
22
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5708674--5708941
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5.8
46
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3
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41
15
22
20
1.90
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53
2.0
52
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1.95
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3.0
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24
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84
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0
557
23
24
15
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5718159--5718544
168
2.2
172
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5
604
23
24
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5721985--5722042
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2.9
20
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0
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2.0
52
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0
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0
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39
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2.0
77
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382
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0
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1.99
5743910--5744372
44
10.4
46
66
18
174
29
20
22
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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