Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  309  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96115424--96115462
17
2.4
16
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4
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2
2
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1.18
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159
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512
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1.89
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35
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2.0
43
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2.3
41
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23
26
25
24
2.00
96146070--96146205
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1.98
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2.0
95
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1.98
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14
182
22
28
19
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1.98
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20
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2.3
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32
1
0
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22
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66
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15
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2
2
67
1.15
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18
3.1
17
76
20
51
58
1
1
37
1.19
96168812--96168859
18
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2
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1.23
96168788--96168862
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2.8
25
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13
78
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1.8
93
96
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3.9
46
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27
29
21
20
1.98
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3.0
29
80
8
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56
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58
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17
10
1.63
96174234--96174310
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96177262--96177432
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1.8
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0
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29
22
20
1.98
96177254--96177434
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3.9
46
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9
233
27
29
21
20
1.98
96181841--96181883
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2.5
17
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0
2
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1.08
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2
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2
100
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0
0
50
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2
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96185321--96185351
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0
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26
1.99
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29
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0
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1.96
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29
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29
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0
111
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32
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1.96
96218450--96218513
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118
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19
25
19
1.96
96224762--96224805
22
2.1
21
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70
2
2
25
1.10
96224844--96224947
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10.4
10
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1
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32
1.21
96225434--96225539
9
11.7
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71
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33
2
0
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1.16
96225418--96225491
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7.7
10
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19
52
39
2
0
58
1.13
96225434--96225537
19
5.7
18
73
15
70
33
2
0
62
1.16
96225458--96225543
36
2.3
38
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30
2
1
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1.12
96233086--96233150
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3.2
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70
12
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13
26
20
40
1.89
96233068--96233168
39
2.6
39
93
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14
25
21
37
1.92
96233068--96233170
18
5.4
18
67
13
62
15
25
22
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96242416--96242479
24
2.7
24
80
4
76
28
1
4
65
1.21
96249413--96249628
93
2.3
92
78
9
235
41
14
7
36
1.75
96255327--96255381
27
2.0
27
100
0
110
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21
10
25
1.86
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2.0
26
100
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104
34
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11
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1.69
96257530--96257608
39
2.1
38
84
15
96
31
1
2
64
1.15
96257533--96257609
20
3.8
20
74
8
68
32
1
2
63
1.16
96264913--96265075
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4.2
38
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1
245
21
23
25
29
1.99
96265068--96265177
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23
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1.99
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54
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200
35
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5
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1.72
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4.3
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12
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17
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1.9
137
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17
1.94
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59
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0
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0
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30
22
20
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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130
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2
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22
21
30
1.99
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86
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282
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29
1.99
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1.99
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262
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30
1.99
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1.99
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23
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193
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0
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28
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
29
29
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.00
96425202--96425380
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24
25
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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