Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  348  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107656642--107656689
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23
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22
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107664916--107665165
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2.0
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20
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12
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107683601--107683659
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4.4
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19
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1.95
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3.2
83
94
1
468
31
20
20
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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107685858--107685962
35
2.9
35
92
4
165
39
10
12
38
1.77
107686431--107686496
17
3.9
17
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16
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34
1
0
63
1.04
107686473--107686522
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1.9
26
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19
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11
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107692287--107692449
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107700997--107701114
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1.96
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2.5
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1.95
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28
15
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30
1.96
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22
1.98
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29
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114
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22
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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22
20
1.97
107736771--107736885
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2.1
56
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36
21
22
19
1.95
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2.3
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29
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107741628--107741742
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2.0
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20
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17
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1.84
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35
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0
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11
26
1.87
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2.9
70
91
0
320
40
22
11
25
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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107808070--107808138
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285
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23
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107832255--107832367
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1
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30
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23
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1.99
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1.97
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5
0
11
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.61
107887837--107888011
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1.95
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1.79
107888867--107888937
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16
83
0
79
39
5
26
28
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107888919--107889012
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1.95
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17
1.95
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0
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7.1
23
95
3
278
29
21
20
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425