Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  390  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119704428--119704465
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2.4
16
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0
58
39
2
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31
1.70
119704650--119704763
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2.0
58
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3
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3
0
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1.24
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4.2
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0
166
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2.0
50
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0
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3.2
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0
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35
4
22
36
1.76
119721616--119721725
26
4.2
26
96
0
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5
23
36
1.78
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2.0
44
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0
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0
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37
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50
1
4
44
1.29
119736256--119736322
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2.7
25
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31
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23
22
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100
0
50
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0
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0
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2.0
27
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0
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1.69
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2.0
21
90
0
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19
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21
29
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100
0
50
40
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8
44
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2.0
17
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52
54
5
2
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1.39
119770801--119770847
20
2.3
21
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10
62
36
0
40
23
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18
2.0
18
88
0
54
36
11
11
41
1.76
119774769--119774812
3
15.7
3
81
13
58
70
2
0
27
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119774767--119774812
11
3.8
12
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11
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69
4
0
26
1.07
119774772--119774822
11
4.6
11
87
0
66
70
3
1
23
1.14
119774727--119774822
22
4.5
22
71
17
67
64
5
3
27
1.30
119774775--119774828
22
2.5
22
81
0
63
70
5
3
20
1.23
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9
100
0
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0
0
24
0.80
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60
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2
20
5
1.17
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14
2.4
14
90
0
50
35
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41
1.74
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15
51
41
0
2
56
1.11
119793582--119793673
44
2.1
44
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4
114
21
18
22
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1.95
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28
3.0
28
86
3
118
27
29
15
27
1.96
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16
2.0
16
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0
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15
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28
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1.68
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18
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18
74
0
98
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13
16
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1.88
119796521--119796632
36
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77
2
118
33
13
16
36
1.88
119803300--119803350
19
2.8
18
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5
75
23
9
7
58
1.56
119812284--119812367
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
119822087--119822117
14
2.3
13
94
5
53
32
0
3
64
1.09
119822159--119822192
15
2.3
15
90
5
52
55
5
2
35
1.39
119833095--119833192
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2.0
49
97
0
187
52
10
9
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1.66
119835013--119835052
21
1.9
21
100
0
80
40
15
10
35
1.80
119835153--119835212
23
2.5
24
78
10
61
55
1
0
43
1.10
119835176--119835221
22
2.0
23
83
4
58
47
0
2
50
1.13
119839734--119839774
2
20.5
2
89
0
64
46
0
2
51
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119841128--119841199
18
4.1
18
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10
60
23
25
18
33
1.97
119844001--119844040
6
6.8
6
82
5
55
17
17
15
50
1.79
119849507--119849542
2
18.0
2
100
0
72
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0
0
50
1.00
119863368--119863444
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3.2
25
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10
70
9
63
1
25
1.32
119863368--119863469
47
2.2
47
85
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134
9
58
1
29
1.41
119872052--119872093
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2.5
18
81
11
54
9
9
4
76
1.15
119872083--119872138
20
2.7
20
81
10
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17
3
3
75
1.10
119874243--119874304
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100
0
124
0
0
50
50
1.00
119874460--119874516
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89
35
0
12
52
1.39
119874456--119874514
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100
32
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14
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1.89
119875114--119875154
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0
60
13
13
0
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13
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17
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20
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22
29
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119894300--119894358
20
3.0
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11
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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25
17
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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18
23
19
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425