Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  332  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103096553--103096957
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5.2
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16
19
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103096723--103097126
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4.7
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29
16
20
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1.94
103096246--103097010
404
1.9
402
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4
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29
16
20
34
1.94
103096941--103096974
16
2.1
16
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0
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88
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242
30
14
19
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103096650--103097054
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2
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2.3
26
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2.3
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2.0
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0
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5
68
33
5
16
45
1.69
103111376--103111418
17
2.6
16
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10
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16
20
9
53
1.70
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3.2
60
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0
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1.89
103118606--103118691
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4.3
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36
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4.5
50
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36
15
20
26
1.93
103125795--103125940
31
4.7
31
86
0
202
26
17
27
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103125942--103125966
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0
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103125974--103126096
47
2.6
47
96
0
219
31
15
22
30
1.95
103125973--103126143
47
3.7
46
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3
218
29
15
25
29
1.96
103126071--103126268
42
4.6
42
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7
249
29
14
26
29
1.95
103127991--103128034
23
2.0
23
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4
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38
4
18
38
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103127979--103128043
22
3.0
22
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18
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1.94
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4.6
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28
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2.4
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24
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19
2.1
19
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1.07
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6
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72
0
5
22
1.04
103158061--103158140
19
4.2
19
72
3
63
21
21
26
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1.98
103160608--103160746
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3.3
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115
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2.0
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1.89
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2.2
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24
7
32
1.83
103172208--103172292
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1.96
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2.2
26
96
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35
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32
1.83
103173894--103173946
26
2.2
23
83
12
63
33
22
3
39
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103174734--103175045
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49
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237
24
28
18
28
1.98
103174788--103175048
94
2.8
92
79
11
241
24
28
18
28
1.98
103179374--103179540
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4.2
40
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24
26
22
26
2.00
103187381--103187547
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4.2
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82
2
185
24
26
22
26
2.00
103192573--103192732
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25
18
25
1.97
103192604--103192717
42
2.6
44
78
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117
35
27
15
21
1.94
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16
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15
100
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6
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2
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95
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1
3
28
1.17
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87
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0
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10
35
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19
2.5
19
83
6
55
38
0
8
54
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
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30
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0
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22
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23
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26
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0
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0
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0.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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7
164
37
10
16
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103381401--103381508
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0
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0
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2.6
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53
17
1
37
42
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425