Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  359  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110966388--110966428
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0
0
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1.00
110968987--110969043
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110969649--110969684
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2.1
17
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0
0
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110976858--110976943
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2.9
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110977432--110977647
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20
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110977639--110977684
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2.0
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60
31
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1.26
110977799--110977850
8
6.5
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3.4
13
87
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13
11
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100
3.8
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390
26
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18
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1.91
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4.4
148
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19
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1.95
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3.3
73
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355
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130
3.0
131
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527
31
16
19
33
1.94
110985539--110985940
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5.5
73
85
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526
30
17
19
33
1.95
110985539--110985910
147
2.5
148
94
1
642
31
16
19
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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60
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110985928--110986380
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5.0
91
79
7
390
28
16
17
36
1.92
110985955--110986380
184
2.4
180
79
8
447
29
16
17
35
1.93
110986049--110986391
177
1.9
178
81
7
408
29
16
17
36
1.92
110986049--110986458
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4.6
84
80
8
286
30
16
18
35
1.92
110987078--110987133
18
3.4
18
68
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61
25
48
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19
1.74
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2.9
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2.0
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2
60
1.34
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60
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2
62
1.26
110988013--110988064
8
6.5
8
78
8
52
30
3
1
63
1.23
110992855--110992923
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11
8
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1.68
111001092--111001198
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2.5
42
89
0
160
17
22
16
42
1.88
111001092--111001218
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3.0
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81
6
148
17
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15
43
1.87
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0
58
0
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1.00
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53
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119
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33
1.10
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2.0
18
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7
15
1.74
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24
2.0
27
85
14
72
60
0
1
37
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111025915--111025954
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2.0
20
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37
2
0
60
1.11
111025936--111025971
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2.1
18
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10
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0
0
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17
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2
0
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1.16
111026983--111027009
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0
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1.92
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82
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153
35
14
23
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1.93
111043673--111043787
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
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1.92
111043673--111043806
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3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
111045534--111045578
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2.3
19
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63
37
4
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0
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1.9
98
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19
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29
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33
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0
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28
9
19
1.82
111084131--111084515
212
1.8
213
94
1
684
34
16
6
43
1.73
111087665--111087695
16
1.9
16
93
0
53
83
0
16
0
0.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
2
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1.11
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11
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0
0
68
0.90
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30
1.9
30
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5
0
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1.24
111089356--111089413
31
1.9
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50
5
0
44
1.24
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15.0
3
100
0
90
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0
0
33
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15
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0
1
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1.11
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40
0
0
59
0.97
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0
0
0.00
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1.80
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18
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0
3
41
1.19
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23
23
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1.98
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4.2
132
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1
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24
23
21
30
1.99
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220
2.4
220
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562
24
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1.98
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264
24
21
23
31
1.99
111123576--111124158
132
4.4
131
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740
23
22
21
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1.98
111123249--111123980
352
2.1
352
88
1
1092
23
23
21
31
1.99
111123213--111124024
264
3.1
263
78
5
664
24
23
21
31
1.99
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220
2.0
220
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0
518
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22
22
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1.98
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484
2.1
484
90
0
1551
23
23
21
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
20.0
2
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0
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47
0
2
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2.0
26
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26
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0
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25
27
25
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1.99
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2.0
628
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2175
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1.96
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48
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4
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16
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1.52
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1.92
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1.96
111180065--111180204
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2.6
54
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23
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1.96
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1.84
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21
1.98
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28
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101
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2.1
47
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1.87
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2.0
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0
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19
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0
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60
0
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1.28
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1.99
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19
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0
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1.35
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1.98
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94
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111210580--111210713
24
5.7
23
70
17
78
24
14
28
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111213572--111213605
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18
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0
8
41
1.34
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9.2
4
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10
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46
0
2
51
1.14
111213596--111213639
8
5.0
9
86
8
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43
0
2
54
1.12
111213583--111213639
26
2.2
27
78
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66
43
0
3
52
1.18
111215671--111215735
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100
0
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1.9
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0
8
51
1.32
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1.90
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15
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20
1.90
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20
1.9
20
88
5
58
40
0
8
51
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425