Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  177  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53604836--53605008
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3.7
46
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21
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28
1.99
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1.8
93
90
0
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21
28
28
1.99
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2.0
67
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5
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1.97
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27
2.0
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27
2.0
26
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34
21
26
17
1.95
53615699--53615832
67
2.0
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2
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21
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19
1.98
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2.0
26
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34
21
26
17
1.95
53618992--53619125
67
2.0
68
85
2
180
30
20
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1.98
53620708--53620759
27
2.0
26
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3
68
34
21
26
17
1.95
53620639--53620772
67
2.0
68
86
2
189
30
21
28
19
1.98
53622339--53622390
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
53623819--53623870
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
53624467--53624529
26
2.4
26
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0
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38
19
19
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1.93
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26
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18
20
36
1.94
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114
1.8
115
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1
337
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10
5
51
1.58
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15
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20
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20
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3
64
16
14
38
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1.88
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5.8
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11
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29
18
26
1.98
53629087--53629406
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3.4
96
75
9
273
25
29
18
26
1.98
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5.2
40
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4
233
25
22
26
25
2.00
53644437--53644587
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3.8
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134
27
23
26
22
2.00
53644473--53644603
40
3.3
40
79
2
156
25
23
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53646190--53646333
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39
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5
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25
22
27
25
2.00
53646233--53646377
40
3.6
40
83
1
130
27
22
26
22
1.99
53646193--53646390
80
2.5
80
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4
202
26
20
26
26
1.99
53649866--53650133
46
5.7
48
72
16
172
23
29
18
27
1.98
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141
1.8
139
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344
24
28
18
28
1.98
53649866--53650139
95
2.9
93
77
10
265
24
29
18
27
1.98
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27
1.9
26
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32
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17
31
1.94
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3.3
20
97
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19
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12
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35
10
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1.86
53656017--53656097
40
2.0
39
86
9
110
35
12
18
33
1.88
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25
4.4
25
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22
20
29
1.98
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4.2
40
80
12
184
23
22
28
26
1.99
53660404--53660571
80
2.1
79
87
4
239
23
22
28
26
1.99
53668130--53668297
40
4.2
40
80
12
184
23
22
28
26
1.99
53668130--53668297
80
2.1
79
87
4
239
23
22
28
26
1.99
53671221--53671272
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
53672959--53673053
40
2.4
40
85
0
118
29
27
20
23
1.98
53672993--53673090
40
2.4
40
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5
117
29
28
16
25
1.97
53680754--53680805
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
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2
100
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50
0
0
50
1.00
53680868--53680927
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53681752--53681786
18
1.9
19
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17
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1.95
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3.3
12
92
0
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7
17
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32
1.77
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34
2.5
32
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23
25
24
25
2.00
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0
50
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0
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48
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0
51
1.00
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39
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20
24
22
1.97
53701628--53701782
78
2.0
76
82
5
186
30
20
26
22
1.98
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2.9
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25
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1.96
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1.8
93
92
0
290
27
28
21
22
1.99
53715442--53715617
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3.8
46
78
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196
28
27
21
22
1.99
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21
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29
27
20
23
1.99
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2.7
13
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26
17
20
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93
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47
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7
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49
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1
635
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29
8
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1.86
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40
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1
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24
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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24
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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26
22
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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