Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106756606--106756634
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
106763502--106763635
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2.2
60
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3
182
38
14
5
40
1.71
106763642--106763675
17
2.0
18
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11
54
52
2
2
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1.31
106768948--106768976
2
14.5
2
100
0
58
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0
0
51
1.00
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2.0
690
90
1
2147
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11
19
29
1.86
106781208--106781277
26
2.7
25
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68
21
24
22
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1.98
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26
2.0
26
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0
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19
25
23
31
1.98
106781325--106781368
22
2.0
22
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2.0
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0
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3
25
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100
0
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0
0
50
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2.5
20
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17
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40
0
1
57
1.10
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30
2.2
30
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2
78
46
6
9
37
1.60
106793771--106793828
30
1.9
30
92
0
98
48
5
5
41
1.48
106793788--106793908
57
2.1
57
93
0
215
38
10
6
44
1.65
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19
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1.8
121
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324
22
25
22
29
1.99
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2.1
24
100
0
100
46
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30
1.75
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3.6
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77
4
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8
1.10
106811856--106811900
12
3.8
12
85
5
56
82
4
4
8
0.94
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15
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0
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17
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19
54
1.68
106814029--106814078
24
2.1
24
100
0
100
30
16
8
46
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106814701--106814868
75
2.3
75
80
7
198
38
21
20
20
1.94
106814802--106814888
34
2.5
34
78
7
95
31
26
20
21
1.98
106822651--106822692
19
2.2
20
82
4
50
33
14
2
50
1.56
106822750--106822926
15
12.5
14
66
26
56
29
7
2
60
1.37
106822750--106822888
44
3.1
43
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13
115
29
7
2
61
1.35
106822848--106823035
3
64.3
3
74
9
97
26
8
3
61
1.40
106822935--106822965
16
1.9
16
93
0
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22
16
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58
1.52
106822940--106822996
16
3.4
16
72
9
51
24
10
5
59
1.51
106822967--106823042
38
1.9
41
84
7
104
23
7
3
64
1.37
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1.8
93
90
0
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30
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21
1.97
106832297--106832466
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3.7
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31
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18
20
1.96
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0
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0
0
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3.6
45
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6
175
31
18
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26
1.98
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1.9
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276
33
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20
24
1.97
106840277--106840305
15
1.9
15
100
0
58
20
6
0
72
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3
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3
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4
182
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17
2.0
17
100
0
68
35
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29
23
1.90
106867657--106867706
7
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8
84
15
68
12
0
2
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0.67
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15
92
3
66
11
0
0
88
0.53
106867657--106867701
16
2.7
17
93
3
74
11
0
2
86
0.65
106867657--106867706
24
2.0
25
96
3
93
12
0
2
86
0.67
106869302--106869352
19
2.7
18
77
11
57
27
11
0
60
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106872746--106872786
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13.7
3
100
0
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68
0
0
31
0.90
106873319--106873362
22
2.1
21
88
12
65
36
2
0
61
1.09
106873620--106873660
19
2.2
19
90
0
64
39
24
4
31
1.76
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42
2.8
42
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0
130
15
18
17
48
1.81
106877010--106877162
63
2.4
63
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2
164
17
19
16
46
1.84
106877022--106877160
21
6.6
21
74
3
109
17
17
16
47
1.83
106881539--106881582
14
3.4
14
70
23
51
40
0
2
56
1.11
106881537--106881582
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100
0
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0
2
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1.11
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2.0
26
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0
97
35
0
16
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1.48
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16
95
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5
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1.77
106893138--106893181
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2.5
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13
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34
11
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1.66
106907441--106907466
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100
0
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5
92
0
53
22
19
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1.89
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50
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50
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33
16
24
25
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19
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27
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151
33
15
23
27
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123
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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2.8
29
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3
1
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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0
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1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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3.1
43
74
14
122
63
1
7
28
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425