Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  292  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90630161--90630229
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2.0
35
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0
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26
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2.00
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329
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2.00
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2.5
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103
28
17
0
53
1.44
90653128--90653199
24
3.1
23
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27
18
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54
1.44
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141
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1.99
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26
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2.0
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100
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1.8
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29
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21
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1.8
93
94
0
308
27
30
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
1.98
90696984--90697051
7
9.4
7
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73
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32
0
20
1.51
90696984--90697051
21
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82
47
32
0
20
1.51
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20
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0
23
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100
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1
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1.28
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17
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2
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1.31
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53
0
0
46
1.00
90724247--90724370
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52
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1
43
1.24
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15
2.1
15
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0
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1.26
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71
2.1
71
98
0
283
43
6
7
43
1.58
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34
2.0
34
94
0
120
15
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1.82
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2.0
44
100
0
178
20
4
22
52
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90741545--90741693
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2.2
68
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20
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1.95
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2.0
43
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29
19
24
1.98
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2.1
33
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32
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1.78
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29
2.0
29
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22
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1.08
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19
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2
2
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29
29
19
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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0
0
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1.97
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18
25
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1.98
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2
100
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11
3
19
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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107
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0
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5
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
7
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425