Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  377  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
27
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32
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0
0
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2.1
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0
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20
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140
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1.98
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0
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0
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0
0
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0.98
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0
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2.0
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47
1.34
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2.2
59
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11
181
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3
3
53
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
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33
2.8
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26
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5
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2.5
29
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5
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23
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106
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1.92
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75
2.4
75
84
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212
32
11
23
33
1.90
115966473--115966638
35
4.6
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174
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11
23
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1.90
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2.0
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51
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20
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2.0
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1.76
115992383--115992468
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2.2
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0
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2.1
14
93
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51
17
0
6
75
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115995475--115995510
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1.00
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27
27
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40
4.1
40
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201
24
20
26
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1.99
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226
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20
26
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24
2.3
24
93
0
94
57
7
7
28
1.52
116081717--116081754
15
2.5
15
95
0
67
47
10
10
31
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
30
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0
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31
30
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20
1.96
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26
2.7
26
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25
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58
4
2
34
1.31
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20
2.3
20
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11
58
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2
11
24
1.40
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29
4.3
29
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7
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13
30
27
1.94
116112218--116112347
29
4.6
28
77
10
131
25
15
33
25
1.95
116116093--116116169
40
1.9
40
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5
111
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6
7
31
1.54
116116110--116116187
40
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38
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108
52
6
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32
1.58
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2
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1.37
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0
0
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1
0
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0
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1.96
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2.2
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0
188
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24
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1.94
116129136--116129166
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2.1
15
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0
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45
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1.68
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100
1.9
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1
308
33
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8
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1.64
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20
2.2
20
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17
1.31
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153
2.0
153
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0
577
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33
0
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1.23
116138807--116138918
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17
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28
28
1.95
116147173--116147201
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
24
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28
0
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24
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2.3
19
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0
20
1.52
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1.58
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0
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0
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1.64
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2.0
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0
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0.92
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0
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2
100
0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
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1.00
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23
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0
0
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0
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0
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1.98
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1.9
94
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4
234
26
19
29
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425