Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  246  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75605903--75605940
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2.0
20
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0
19
1.51
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1.96
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27
3.0
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1.94
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1.9
27
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0
68
19
17
25
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1.93
75616721--75616748
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0
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2.1
31
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0
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1.93
75616990--75617250
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11.0
24
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21
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25
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3.1
27
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25
22
32
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1.80
75618739--75618955
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4.0
53
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18
41
1.82
75618832--75618969
27
5.2
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145
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41
1.80
75618832--75618969
53
2.6
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8
161
28
7
22
41
1.80
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27
9.8
27
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5
309
40
8
21
28
1.82
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80
3.3
79
81
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248
40
7
21
30
1.81
75618948--75619201
107
2.4
105
84
2
339
41
8
20
29
1.82
75619214--75619303
27
3.3
27
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119
32
10
17
40
1.83
75619197--75619303
54
2.0
54
81
7
128
30
10
20
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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1.82
75621687--75621716
16
1.9
15
93
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51
43
6
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40
1.64
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45
5.1
47
90
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327
28
21
20
29
1.98
75622342--75622593
23
11.0
24
87
10
334
28
22
20
28
1.98
75622652--75622708
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
75622648--75622710
20
3.2
20
95
0
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36
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25
1.9
25
86
0
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25
12
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1.91
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19
25
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1.95
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27
22.0
27
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209
35
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20
35
1.83
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3.5
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81
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290
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7
19
31
1.80
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4.9
54
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332
41
7
20
29
1.80
75624300--75624555
133
1.9
134
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345
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1.79
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2.0
51
92
0
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43
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9
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1.83
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14.6
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187
37
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1.85
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54
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53
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161
36
19
12
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1.89
75634794--75635043
81
3.1
80
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299
34
19
20
26
1.96
75634821--75635043
27
8.3
27
91
0
347
34
18
21
26
1.96
75635438--75635516
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2.5
31
89
0
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18
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13
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1.78
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19
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14
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1.79
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13.7
27
73
10
175
37
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9
32
1.85
75637500--75637822
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6.0
54
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20
9
34
1.84
75637804--75638053
27
9.3
27
88
1
313
36
17
20
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75637773--75638053
54
5.2
54
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286
37
17
18
26
1.93
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6
12.8
6
77
15
81
17
17
15
49
1.80
75638448--75638526
31
2.5
31
91
0
122
17
17
15
49
1.80
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21
2.9
21
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14
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36
18
1.91
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2.1
42
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24
1.97
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42
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16
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28
1.96
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2.6
40
77
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107
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19
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1.94
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1.96
75652139--75652523
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2.0
196
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2
443
31
17
21
30
1.96
75652779--75652888
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15.4
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14
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0
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26
1
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1.59
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24
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39
1.62
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1
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0
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25
27
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22
25
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17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
29
1.98
75673992--75674351
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7.6
47
71
11
234
21
29
19
29
1.98
75673992--75674352
141
2.6
139
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6
334
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29
19
29
1.98
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55
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28
25
21
1.99
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10
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21
28
21
28
1.99
75681443--75681661
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94
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20
27
1.98
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1.93
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0
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1.97
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1.98
75686832--75686931
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1.97
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4
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0
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0
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1.00
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1.93
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27
1.96
75694229--75694518
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1.97
75694273--75694517
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2.8
86
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3
269
24
17
27
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75694281--75694518
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128
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1.97
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27
1.98
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1.97
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2.3
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1.96
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1.9
129
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2
304
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1.97
75695056--75695327
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1.97
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0
0
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43
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3
130
26
16
28
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75707535--75707559
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12
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0
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0
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1.96
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16
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0
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38
3
3
54
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425