Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  215  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65603383--65603460
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3.2
24
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0
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12
28
0
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1.34
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15
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29
0
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43
1.55
65604753--65604796
14
3.1
14
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52
27
0
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1.57
65604753--65604812
29
2.1
29
93
0
102
28
0
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1.56
65605786--65605830
14
3.3
14
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6
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48
15
0
35
1.45
65606685--65606810
63
2.0
63
100
0
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20
19
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40
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1.73
65612638--65612674
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11
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29
2.0
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43
5
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37
16
24
21
1.94
65618684--65618891
108
1.9
111
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1.94
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53
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211
34
18
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20
1.95
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2.1
32
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25
20
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1.99
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3.2
43
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152
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1.91
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21
1.9
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0
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20
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0
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0
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40
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209
25
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26
26
2.00
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2.0
79
82
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194
26
21
26
25
1.99
65658196--65658402
46
4.5
44
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11
202
27
18
30
24
1.98
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2.0
29
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22
3
40
1.70
65667368--65667554
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65667391--65667554
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71
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0
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18
28
17
35
1.94
65667391--65667588
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
65674937--65675123
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
65674960--65675123
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
65674960--65675157
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
65695996--65696071
40
1.9
40
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0
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30
28
17
23
1.97
65699596--65699707
42
2.7
42
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27
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25
1.97
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1.95
65699727--65699912
48
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48
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284
29
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1.96
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37
3.4
37
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151
26
26
17
28
1.98
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22
2.4
22
100
0
104
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26
23
1.98
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29
2.0
29
89
0
89
43
27
0
29
1.55
65703888--65703935
15
3.3
15
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5
53
43
25
0
31
1.55
65705241--65705296
30
1.9
28
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7
76
53
3
30
12
1.55
65711794--65711951
43
3.7
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79
1
156
24
17
27
30
1.97
65725366--65725436
15
4.8
14
86
8
97
14
14
15
56
1.68
65725360--65725436
30
2.6
30
89
4
111
15
12
15
55
1.69
65728473--65728588
43
2.7
43
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6
137
24
18
26
31
1.97
65728558--65728657
51
2.0
51
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0
155
23
17
27
33
1.96
65730750--65731004
55
4.8
52
79
8
223
37
15
24
22
1.93
65730757--65730957
108
1.8
110
86
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291
34
16
24
23
1.95
65739909--65740163
55
4.8
54
80
9
278
36
17
25
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65739916--65740116
108
1.8
110
90
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327
34
17
25
22
1.96
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16
1.9
16
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0
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41
0
22
35
1.54
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37
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33
20
20
1.97
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5.0
49
96
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31
26
7
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1.85
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2.6
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79
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110
23
22
24
29
1.99
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40
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27
23
19
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1.99
65755420--65755506
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2.3
36
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5
147
25
33
20
20
1.97
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1.85
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4.8
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226
37
16
25
21
1.93
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108
1.8
110
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327
34
17
25
22
1.95
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16
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0
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1.54
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12
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1.55
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50
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1
183
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26
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28
1.98
65778459--65778662
65
3.2
65
95
0
374
30
22
25
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65780202--65780298
30
3.2
31
73
5
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27
28
15
27
1.96
65782798--65782860
5
12.0
5
79
15
58
76
3
17
3
1.05
65782798--65782860
11
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10
74
20
58
76
3
17
3
1.05
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12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
65782923--65782978
18
3.1
18
76
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51
69
3
19
7
1.27
65782929--65783010
30
2.7
31
79
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2
21
12
1.40
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21
1.9
21
89
5
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41
20
17
20
1.91
65795285--65795380
30
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30
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14
27
29
1.95
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30
3.2
30
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2
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28
26
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28
1.96
65798459--65798507
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2.3
21
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0
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26
20
20
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1.97
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2.0
31
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24
1.96
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30
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28
16
27
27
1.97
65811209--65811280
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103
26
18
29
26
1.98
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2.0
43
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0
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25
1.86
65814747--65815580
421
2.0
407
90
3
1299
27
17
17
37
1.93
65816312--65816400
6
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6
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4
21
2
71
1.14
65816312--65816395
33
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10
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4
21
2
71
1.16
65817799--65817837
18
2.2
18
90
0
60
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0
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1.40
65817785--65817862
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24
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0
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57
0
28
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1.37
65820319--65820363
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14
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35
0
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2.6
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22
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1.95
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30
3.2
30
76
2
106
27
27
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65825832--65825888
11
5.5
10
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1
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3
1.00
65825832--65825888
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
65825832--65825888
16
3.7
14
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17
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77
1
17
3
1.00
65825936--65825966
12
2.6
12
100
0
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12
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65825969--65825993
12
2.1
12
100
0
50
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0
16
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1.02
65825963--65826017
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3.1
18
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1
20
7
1.20
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29
2.7
30
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9
94
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0
22
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27
16
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0
107
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27
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27
2.8
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21
22
17
1.94
65832324--65832379
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2.1
27
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14
1.91
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3.0
22
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32
23
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20
1.98
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27
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25
20
18
34
1.96
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2.3
80
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26
22
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1.96
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18
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14.7
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65833204--65833601
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4.9
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31
7
21
39
1.81
65833261--65833601
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54
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2
328
30
7
21
40
1.81
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2.3
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1
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29
26
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1.96
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3.2
30
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27
15
29
28
1.96
65844858--65844911
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24
1.96
65846662--65846746
30
2.8
30
82
7
100
11
21
1
65
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65846815--65846860
15
3.1
14
84
12
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4
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2
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1.06
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12
2.5
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15
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6
71
1.26
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2.9
30
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0
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27
1.97
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1.62
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24
2.00
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26
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0
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1.95
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4.7
12
86
11
67
75
5
5
13
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425