Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  323  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100547537--100547603
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2.0
33
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0
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2
43
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100550219--100550267
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6
62
36
6
0
57
1.24
100550219--100550269
19
2.5
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6
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0
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0
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50
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4.2
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1.99
100574885--100575052
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26
22
1.99
100607260--100607388
40
3.2
39
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6
152
24
22
27
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48
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1.9
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45
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0
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5
0
47
1.25
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2.5
42
93
0
178
30
13
31
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
27
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2
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24
31
1.94
100626791--100626849
27
2.2
27
84
6
75
28
16
22
32
1.96
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4
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23
25
28
23
1.99
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18.0
2
94
0
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2
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2.5
28
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2
106
28
14
25
31
1.95
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30
2.0
30
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0
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3
13
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1.47
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5
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1.52
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2.0
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24
2.2
24
89
0
77
36
3
9
50
1.54
100656006--100656069
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24
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1.57
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17
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0
0
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28
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1
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1.12
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16
80
8
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36
0
1
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1.05
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21
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23
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33
1
3
61
1.25
100661368--100661544
25
7.3
25
75
13
140
32
5
6
54
1.50
100661368--100661470
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11
140
32
2
5
59
1.36
100661383--100661542
26
6.4
26
71
16
124
33
6
6
53
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100665565--100665609
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2.0
22
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6
48
1.72
100673873--100674113
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3.2
73
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5
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26
16
18
38
1.92
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2.8
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82
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312
26
16
17
39
1.91
100674185--100674217
14
2.4
14
94
0
57
15
18
3
63
1.43
100674098--100674308
101
2.1
103
90
2
336
25
15
16
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1.87
100674213--100674385
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2.3
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255
27
15
19
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1.92
100673947--100674444
268
1.9
265
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668
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15
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2.6
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0
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1.93
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15
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0
0
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0
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12.8
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20
165
33
5
5
55
1.45
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1
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186
28
17
30
23
1.97
100702228--100702268
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
100705691--100705723
10
3.4
10
83
8
50
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100705686--100705723
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5
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0
0
63
0.95
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3
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34
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11
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2.0
27
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0
92
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2
20.5
2
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0
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0
0
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1.00
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25
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27
24
2.00
100716768--100716992
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40
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10
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25
22
27
24
2.00
100716769--100716992
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1.9
120
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287
25
22
27
24
2.00
100716821--100717025
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79
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7
213
26
21
27
24
1.99
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19
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1.94
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1.9
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0
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0
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1.54
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100755127--100755187
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4
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1.07
100755127--100755182
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1.00
100755127--100755182
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1
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1.00
100765144--100765185
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2.3
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19
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9
9
40
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7.9
27
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3
171
40
18
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1.84
100773178--100773392
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54
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19
10
30
1.84
100773181--100773392
81
2.6
80
78
11
227
40
18
9
31
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100773346--100773406
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2.3
27
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14
27
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2.7
22
78
0
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25
21
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2.1
102
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0
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41
1.80
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27
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27
1.84
100784471--100784648
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3.3
54
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5
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8
28
1.83
100784479--100784861
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4.8
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1.86
100784500--100784861
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1.84
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20
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1.96
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1
196
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1.97
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20
22
1.97
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1.95
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26
27
1.99
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0
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36
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418
35
21
14
28
1.93
100803933--100804344
73
5.6
73
79
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440
35
21
14
28
1.93
100803933--100804336
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3.7
108
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35
21
14
28
1.93
100803945--100804455
36
13.7
39
80
3
255
34
20
14
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100806953--100807050
25
3.9
25
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12
16
34
1.86
100809115--100809215
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3.5
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1.95
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29
2.7
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1.95
100816962--100817062
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1.95
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0
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0
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14
3.8
16
72
23
61
15
0
14
70
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425