Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  284  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87976306--87976351
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20
2.3
21
82
14
62
26
17
28
28
1.98
87980500--87980611
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25
25
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0
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419
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1.96
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28
92
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29
25
10
34
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
1.97
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49
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1.91
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2.0
138
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1.87
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2.1
12
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0
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20
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2.7
27
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21
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1.98
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25
22
29
1.99
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78
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22
26
1.99
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4.6
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22
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23
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1.99
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2
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1.60
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4.2
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0
262
23
22
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1.99
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88104389--88104491
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25
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54
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152
25
12
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27
5.7
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1
101
35
7
23
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1.84
88104406--88104512
54
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126
28
10
25
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88104482--88104612
54
2.4
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0
190
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28
1.84
88107536--88107701
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4.2
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22
27
27
1.99
88107939--88107980
22
1.9
22
85
9
59
33
9
14
42
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88111193--88111226
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1.88
88112517--88112681
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3.6
46
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10
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1.89
88112655--88112800
47
3.1
47
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204
26
29
10
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1.90
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29
2.4
29
90
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104
30
32
14
22
1.94
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4.4
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314
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21
24
1.99
88116755--88116925
79
2.2
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317
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28
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23
1.99
88118410--88118591
46
4.0
46
93
0
285
24
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1.87
88118425--88118637
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1.88
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3.1
39
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15
166
27
28
10
34
1.89
88118658--88118746
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160
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19
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24
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22
2.0
22
86
8
63
53
4
0
41
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
61
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0
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31
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4.5
40
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4
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25
27
20
25
1.99
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40
4.5
40
83
4
191
25
27
20
25
1.99
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29
2.4
31
79
9
85
29
14
9
46
1.76
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17
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4
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54
2
0
43
1.14
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11
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11
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0
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0
7
77
0.97
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0
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1.88
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1.98
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1.98
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1.98
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0
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1.09
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2.00
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23
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2.00
88181817--88181980
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4
0
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0
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0
0
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1
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1.31
88182234--88182283
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11
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2
60
1.32
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2.5
45
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0
195
33
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23
23
1.97
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4.7
88
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2
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32
20
24
21
1.98
88194412--88194881
44
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7
254
32
20
24
22
1.98
88194457--88195147
88
7.8
86
78
8
558
32
20
24
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88196641--88196943
3
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3
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3
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5
1
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1.31
88197013--88197062
11
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11
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1.32
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2.0
19
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2
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0
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1.60
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19
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40
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0
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12
12
1.38
88219036--88219102
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2.0
34
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1.42
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23
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1.99
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1.97
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74
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1.94
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188
2.0
187
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27
1.97
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20
0
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1.53
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2.1
28
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23
0
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14
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0
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9
0
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0
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1.9
39
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0
114
46
20
0
33
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88229218--88229310
30
3.2
30
80
9
102
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1
30
1.58
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79
2.6
80
78
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30
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22
1.99
88234975--88235082
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2.7
40
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0
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1.99
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1.52
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0
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4
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2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425