Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  220  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66728572--66728833
46
5.7
46
92
0
398
40
14
22
22
1.90
66728522--66728833
138
2.3
130
88
4
435
39
14
23
22
1.91
66730592--66730629
18
2.1
18
100
0
76
36
39
0
23
1.55
66732370--66732406
13
2.5
15
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12
51
21
0
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70
1.13
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43
6.2
43
87
3
336
26
15
27
29
1.96
66734789--66734832
18
2.3
18
84
7
52
50
2
13
34
1.55
66738743--66738857
28
4.1
27
80
10
117
36
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24
17
1.94
66742491--66742526
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2.0
18
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0
54
27
11
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2.3
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60
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4
17
1.29
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20
125
28
28
20
22
1.99
66770084--66770253
41
4.2
40
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18
161
27
27
22
22
1.99
66774629--66774759
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
66774629--66774759
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
66781954--66782043
31
3.1
31
84
14
136
24
22
16
36
1.94
66781957--66782040
26
3.0
26
89
8
114
26
23
17
32
1.97
66782234--66782398
23
7.0
24
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6
248
26
22
22
29
1.99
66782234--66782398
47
3.5
48
90
6
248
26
22
22
29
1.99
66782448--66782500
17
2.9
18
91
8
81
32
18
11
37
1.87
66782490--66782569
21
3.5
24
74
17
80
38
17
6
37
1.75
66782538--66782590
25
2.2
24
86
10
72
43
18
3
33
1.68
66782506--66782590
21
4.1
21
70
23
63
40
17
5
36
1.74
66782460--66782591
61
2.1
62
87
6
189
38
18
6
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66782594--66782641
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1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
66786941--66786987
22
2.3
20
82
13
60
70
8
4
17
1.29
66787473--66787542
25
2.8
24
79
14
70
58
0
2
38
1.13
66788327--66788355
7
4.1
7
100
0
58
13
0
72
13
1.13
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2.0
98
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0
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11
13
34
1.81
66791324--66791381
30
2.0
30
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82
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12
8
32
1.71
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24
3.6
24
93
0
156
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1.94
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2
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0
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0
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48
1.17
66803118--66803182
24
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25
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13
71
41
27
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13
1.87
66804728--66804835
43
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44
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7
132
33
16
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29
1.95
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15
100
0
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7
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100
0
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0
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1.57
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7
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20
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51
1
15
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1.53
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3
16.7
3
95
0
91
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0
0
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0.94
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2.1
28
96
0
107
36
3
18
41
1.68
66811469--66811517
25
2.1
22
85
11
62
26
0
4
69
1.06
66818187--66818352
48
3.5
48
77
4
167
23
25
19
31
1.98
66818187--66818401
46
4.6
47
78
8
188
22
26
20
31
1.98
66818218--66818394
94
1.9
93
84
6
241
22
25
20
31
1.98
66824068--66824185
46
2.6
45
85
9
159
27
19
28
24
1.99
66831765--66831877
46
2.5
44
87
7
147
28
18
30
23
1.98
66837077--66837217
52
2.7
52
89
0
219
21
28
31
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66837617--66837647
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
66838466--66838525
26
2.3
26
88
0
93
38
21
21
18
1.94
66838451--66838528
26
3.0
27
79
7
90
37
20
23
19
1.95
66839539--66839566
13
2.2
13
100
0
56
14
14
0
71
1.15
66851189--66851250
30
2.0
30
84
9
81
51
12
14
20
1.75
66861035--66861077
19
2.4
19
88
7
63
37
13
11
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1.82
66861043--66861079
19
1.9
19
100
0
74
37
10
16
35
1.83
66861043--66861102
19
2.8
22
85
9
72
36
8
16
38
1.79
66861370--66861405
17
2.1
18
89
5
56
30
0
0
69
0.89
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2.7
40
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15
104
30
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18
24
1.98
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1.9
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48
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2
27
1.61
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2.0
15
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51
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1.47
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1.99
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77
2.3
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269
23
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22
24
1.99
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3.7
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23
29
22
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1.99
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50
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29
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25
16
29
28
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30
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0
89
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24
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1.93
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28
21
28
21
1.99
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28
22
27
21
1.99
66891141--66891447
94
3.3
93
83
7
322
28
21
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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4
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27
21
22
28
1.99
66897059--66897225
47
3.5
48
88
4
232
26
21
22
29
1.99
66897060--66897226
71
2.3
71
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3
255
26
21
22
28
1.99
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9
5.9
9
73
15
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21
8
35
1.84
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20
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11
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11
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20
12
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2.0
24
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18
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27
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1.85
66898665--66899004
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1.85
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1.92
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17
25
1.97
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18
25
1.98
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36
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0
0
50
1.00
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4.7
40
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2
324
26
22
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66914128--66914345
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23
27
22
1.99
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1.98
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1.98
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2.0
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0
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28
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20
1.83
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2.5
28
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2
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1.83
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28
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22
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1.98
66937328--66937585
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140
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324
22
27
19
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1.98
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25
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1.35
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27
32
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18
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29
29
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1.95
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2.0
84
100
0
342
38
7
16
38
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66971389--66971450
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2.1
30
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0
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35
1.93
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39
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1
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26
29
22
1.99
66986259--66986533
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473
21
26
29
22
1.99
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1.94
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1.99
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1.96
67017475--67017574
24
4.2
24
83
8
109
35
21
23
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425