Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  375  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115405905--115405967
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5
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1
1
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27
1
1
69
1.05
115405887--115405978
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3.1
30
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3
1
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1.07
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2.2
23
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39
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2.6
23
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42
6
27
22
1.78
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2.0
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100
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42
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28
1.79
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28
3.0
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46
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115415755--115415848
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3.6
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58
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0
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1.9
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26
0
36
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24
28
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24
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25
1.94
115467476--115467592
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4.7
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88
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22
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2.0
43
97
0
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29
11
16
43
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
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0
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38
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1.9
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0
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29
17
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1.97
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1.96
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4.7
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25
22
1.99
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1.9
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26
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1.99
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2.3
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80
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204
28
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26
21
1.99
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2.8
23
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9
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22
27
1
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0
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0
0
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2.0
41
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2.3
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30
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6.1
7
94
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77
44
0
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17
20
32
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2.0
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54
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1.67
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39
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55
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1.34
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40
1.9
40
86
2
109
23
22
17
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115536148--115536195
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2.0
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37
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6
1.81
115537442--115537482
21
2.0
21
85
0
55
34
0
21
43
1.53
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3.1
25
73
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22
24
22
30
1.99
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2.0
32
100
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24
38
1.80
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1.9
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22
1.97
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1.8
96
85
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248
24
20
30
24
1.98
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1.98
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2.8
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7
299
27
19
30
23
1.98
115552694--115553015
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6.9
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78
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1.98
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143
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353
26
19
30
22
1.98
115552694--115553016
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3.5
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273
26
19
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23
1.98
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664
29
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25
21
1.99
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2.1
21
87
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63
17
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112
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2
31
1.64
115562900--115563034
57
2.4
57
83
0
162
45
21
2
31
1.64
115562905--115563034
48
2.7
48
79
3
145
45
21
2
30
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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20
19
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1.97
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20
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1.98
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0
0
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20
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1
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19
0.95
115586126--115586182
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19
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0
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24
0
0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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147
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2.1
22
92
0
76
57
12
8
21
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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26
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0
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22
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11
94
50
1
1
47
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425