Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  331  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102830678--102830774
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6.5
15
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16
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2
1
40
1.18
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0
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0
0
48
1.00
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31
100
0
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1.51
102831065--102831165
37
2.7
37
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3
34
1.36
102832039--102832089
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3.8
13
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70
1
1
25
1.08
102832465--102832522
24
2.4
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46
1
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102834371--102834424
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2.0
27
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3
81
57
0
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38
1.17
102834351--102834537
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1.9
101
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0
1
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60
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1.35
102837378--102837421
16
2.7
16
86
10
54
65
11
4
18
1.40
102838012--102838057
16
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12
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65
0
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32
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2.1
16
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0
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32
2
32
32
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102843277--102843315
16
2.3
17
86
8
53
46
2
20
30
1.64
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23
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24
2.2
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20
24
20
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3
0
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1.16
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15
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51
20
0
0
79
0.74
102848921--102848957
2
19.0
2
94
5
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51
0
0
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1.00
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10
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42
1.59
102854204--102854229
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102855789--102855834
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2.1
22
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36
0
4
58
1.18
102870791--102870854
14
4.4
14
74
14
58
64
12
14
9
1.50
102871703--102871735
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6
100
0
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48
18
0
33
1.48
102877043--102877111
35
2.0
35
100
0
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21
28
1.99
102893843--102893971
44
2.8
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4
152
34
13
24
27
1.93
102901415--102901521
40
2.6
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114
25
25
21
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1.9
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23
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5.0
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2.0
224
94
0
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25
14
16
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102915768--102915815
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39
0
2
58
1.10
102915768--102915808
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0
2
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26
2.0
26
96
0
93
31
9
35
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1.87
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1.9
32
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77
50
0
26
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1.50
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23
2.1
21
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8
4
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1.54
102922053--102922289
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2.6
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1
404
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13
37
1.92
102922960--102923001
21
2.0
22
86
13
61
28
16
19
35
1.93
102926859--102926929
33
2.2
33
84
5
90
12
4
46
36
1.62
102929048--102929144
31
3.1
31
90
3
149
39
9
17
34
1.82
102938182--102938227
8
6.1
8
80
14
62
60
0
0
39
0.97
102938182--102938227
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3.3
13
85
14
65
60
0
0
39
0.97
102938184--102938222
16
2.4
16
95
0
69
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102938778--102938848
29
2.4
31
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17
80
39
2
9
47
1.51
102943476--102943526
20
2.5
20
90
0
75
11
29
37
21
1.89
102944055--102944090
13
2.7
13
91
4
54
52
19
0
27
1.46
102944423--102944519
40
2.5
39
81
8
119
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25
24
18
1.98
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3
11.0
3
93
6
59
64
0
2
32
1.08
102955697--102955761
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3.2
21
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20
57
40
23
26
10
1.87
102955686--102955779
39
2.4
39
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1.91
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1.92
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18
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2.3
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180
24
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0
0
18
0.70
103014500--103014562
27
2.3
27
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0
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14
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2.1
40
88
0
125
24
16
27
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
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28
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42
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0
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1.38
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2.0
245
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2.0
26
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0
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1
3
69
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.3
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6
6
53
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103073834--103073895
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10
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1.89
103082379--103082551
75
2.4
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210
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1.89
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16
410
28
16
20
34
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425