Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  60  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16406962--16407136
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3.8
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199
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29
20
21
1.98
16406970--16407141
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1.8
93
91
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283
27
29
20
21
1.98
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46
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116
29
29
20
21
1.98
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18
2.0
19
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0
0
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2.00
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2.00
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0
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100
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0
0
50
1.00
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2.5
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2
133
28
12
27
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1.93
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20
2.1
20
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20
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55
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13
2.6
13
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3
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19
2.3
20
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3
65
15
13
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1.86
16461314--16461392
38
2.1
39
82
2
97
16
15
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37
1.89
16461314--16461380
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3.5
19
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16
16
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1.91
16467405--16467485
10
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9
73
17
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64
1
1
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16467403--16467485
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19
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2
1
33
1.16
16467403--16467485
27
3.0
27
75
18
82
62
2
1
33
1.16
16467416--16467517
34
3.0
33
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0
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1.11
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2.9
19
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12
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24
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24
27
23
24
2.00
16498077--16498215
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2.00
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1.95
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3.9
37
90
0
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31
15
23
1.95
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37
4.4
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28
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16
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1.96
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3.0
46
86
0
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35
1.86
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3
442
26
29
10
33
1.90
16511477--16511546
35
2.0
35
100
0
140
37
17
17
28
1.92
16517050--16517230
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46
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9
233
20
21
29
27
1.98
16517052--16517222
93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
16520182--16520235
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3.6
15
76
0
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11
18
12
57
1.64
16520178--16520246
30
2.3
30
85
2
95
8
17
17
56
1.65
16522116--16522296
46
3.9
46
83
9
251
20
21
29
27
1.98
16522121--16522289
93
1.8
93
96
0
311
21
21
28
27
1.99
16524666--16524897
48
4.9
48
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3
335
21
31
22
24
1.99
16524666--16524884
95
2.3
96
90
2
343
21
30
23
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16528683--16528754
29
2.5
28
88
6
101
30
16
26
26
1.97
16536599--16536670
29
2.5
28
88
6
101
30
16
26
26
1.97
16553027--16553079
10
5.2
10
78
10
54
66
3
0
30
1.10
16553027--16553082
21
2.7
21
83
2
69
64
3
0
32
1.11
16553921--16554029
10
11.7
9
71
16
71
31
1
4
62
1.26
16553820--16554029
9
22.8
9
67
18
87
32
2
4
60
1.32
16554520--16554557
18
2.1
18
85
9
51
52
5
2
39
1.38
16554640--16554693
20
2.8
20
81
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60
51
9
0
38
1.34
16554718--16554770
9
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9
80
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52
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1
3
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1.26
16555769--16555806
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0
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0
0
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31
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93
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28
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0
0
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0
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30
4
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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202
2.3
203
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7
650
27
0
13
59
1.36
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20
1.9
21
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5
20
30
1.73
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18
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17
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11
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10
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12
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0
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18
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1.95
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2
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0
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29
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0
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6
14
34
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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0
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0
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14
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56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425