Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  69  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19265333--19265371
17
2.3
17
86
8
53
74
0
7
17
1.05
19265564--19265646
29
2.9
30
91
5
127
6
4
13
75
1.14
19265564--19265647
30
2.9
30
87
5
120
5
4
13
76
1.13
19265569--19265656
29
2.9
30
79
6
97
4
4
13
77
1.08
19265564--19265668
34
3.4
29
80
15
122
5
3
15
75
1.14
19265609--19265671
17
3.7
17
70
8
65
3
3
20
73
1.12
19266492--19266552
29
2.1
30
93
3
106
40
29
9
19
1.84
19266647--19266681
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
19266332--19267065
252
2.9
248
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6
826
33
20
17
28
1.95
19266924--19267084
74
2.1
74
87
6
236
29
21
21
27
1.98
19266757--19267230
165
2.8
165
88
3
664
30
21
20
28
1.98
19267000--19267174
90
2.0
89
85
3
235
32
18
22
26
1.97
19267088--19267249
75
2.1
76
84
4
211
32
18
19
29
1.96
19267284--19267317
13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59
19267389--19267564
71
2.5
70
86
5
223
33
23
13
29
1.93
19279341--19279380
21
1.9
21
85
10
55
62
7
0
30
1.23
19281416--19281599
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
19289529--19289712
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
19300227--19300266
21
1.9
21
89
0
62
17
32
22
27
1.96
19302929--19303096
46
3.7
46
80
1
185
18
18
23
39
1.92
19307624--19307836
46
4.6
45
81
8
216
26
29
17
27
1.97
19307573--19307835
94
2.8
92
77
11
277
25
28
18
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19311862--19312172
40
7.8
40
92
2
500
26
27
19
26
1.99
19311862--19312172
159
2.0
159
91
1
507
26
27
19
26
1.99
19313405--19313501
37
2.6
37
90
0
149
26
31
17
23
1.97
19313548--19314700
48
24.0
48
90
0
1813
30
27
6
35
1.82
19317442--19317497
28
2.0
28
82
6
69
25
5
5
64
1.36
19319058--19319103
20
2.3
20
92
0
74
36
2
0
60
1.09
19319066--19319114
20
2.5
20
96
0
89
34
6
0
59
1.22
19320625--19320680
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2.3
24
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6
78
44
0
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50
1.25
19323457--19323494
13
3.2
12
85
10
51
0
0
10
89
0.49
19323457--19323495
18
2.3
16
91
8
60
0
0
12
87
0.55
19325396--19325421
2
13.0
2
100
0
52
0
50
0
50
1.00
19327152--19327573
209
2.0
205
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5
501
24
13
17
44
1.85
19327536--19327663
52
2.5
52
84
6
163
38
10
22
28
1.88
19336428--19336481
2
27.0
2
96
0
99
1
0
48
50
1.11
19337491--19337533
18
2.4
18
88
0
59
9
13
6
69
1.35
19343770--19343828
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
19343799--19343848
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
19343814--19343866
26
2.0
26
82
7
63
33
0
1
64
1.05
19346703--19346960
40
6.5
40
88
4
346
24
27
24
23
2.00
19349892--19349931
20
2.0
20
90
0
62
52
0
2
45
1.14
19355414--19355745
47
7.1
47
94
0
522
34
10
28
25
1.90
19355627--19355702
22
3.3
22
66
28
59
34
11
28
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19355719--19355855
46
3.0
46
91
0
220
34
8
31
25
1.86
19357340--19357491
40
3.8
40
89
2
218
25
23
25
25
2.00
19357503--19357655
28
5.4
27
73
9
117
22
18
28
30
1.97
19357499--19357655
57
2.8
57
87
0
215
22
18
28
30
1.97
19357531--19357632
29
3.6
29
75
7
100
23
17
30
28
1.97
19361459--19361743
47
6.1
47
91
0
410
34
10
29
25
1.90
19361717--19361853
46
3.0
46
89
0
211
34
8
31
26
1.85
19363831--19364038
40
5.2
40
85
2
251
22
21
29
26
1.99
19370126--19370235
26
4.2
26
94
2
186
33
4
25
36
1.76
19372907--19373097
39
4.9
39
94
0
319
21
31
23
24
1.98
19375032--19375089
26
2.2
26
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71
31
25
13
29
1.94
19375195--19375309
27
4.3
26
84
7
140
16
22
23
37
1.94
19375195--19375309
54
2.1
54
87
3
160
16
22
23
37
1.94
19376312--19376503
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2.0
96
86
0
267
34
15
34
15
1.89
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24
2.2
25
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15
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1
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22
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51
10
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24
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1
1
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1.16
19390518--19390549
16
1.9
17
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0
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1.08
19391307--19391365
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30
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220
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25
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1.98
19394228--19394402
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2.3
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230
28
25
23
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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0
0
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14
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0
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0
50
20
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30
1.9
30
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0
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29
1.91
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21
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20
1.98
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19
2.0
19
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0
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5
10
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1.58
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44
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7
158
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30
20
26
1.99
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46
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180
23
28
20
28
1.99
19437754--19437832
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15
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2.00
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24
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1.99
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23
24
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22
1.99
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26
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27
22
2.00
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186
23
24
29
22
1.99
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22
29
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22
28
1.96
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1.9
223
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0
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21
30
1.96
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32
17
22
27
1.96
19492928--19493131
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40
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27
22
23
1.99
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64
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123
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29
1.90
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1.9
18
100
0
70
22
14
11
51
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19497941--19498075
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2.2
120
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22
22
28
26
1.99
19512526--19512748
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5.6
40
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367
21
22
28
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1.99
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2.0
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1.96
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0
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0
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2.2
42
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132
34
20
15
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19583179--19583248
25
2.8
25
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24
2.00
19584183--19584327
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42
1.77
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7
20
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1.81
19584252--19584642
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14.5
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19584469--19584643
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2.3
12
100
0
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28
46
0
25
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425