Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30534600--30534719
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4.2
29
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14
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0
4
34
1.21
30534601--30534703
29
3.6
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95
60
0
4
33
1.25
30541378--30541479
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3.5
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0
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23
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1.95
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2.3
93
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1.98
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4.6
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1.8
140
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13
2
0.86
30562605--30562649
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2.1
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72
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13
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0.86
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27
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3.5
28
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28
13
27
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1.95
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2.5
29
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1.94
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28
3.2
28
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105
29
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25
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24
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28
21
21
1.99
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1.8
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1
313
28
29
21
21
1.98
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2.0
30
90
0
93
30
25
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1.85
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3.5
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128
29
28
14
28
1.95
30621372--30621551
77
2.3
80
83
9
237
25
27
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30621370--30621551
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230
25
28
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24
1.99
30629361--30629542
78
2.3
81
86
6
257
25
27
22
24
2.00
30629359--30629542
40
4.7
40
86
8
252
25
27
22
24
2.00
30637292--30637394
29
3.6
29
86
2
136
28
26
16
29
1.97
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29
2.5
29
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103
26
31
16
26
1.96
30640968--30641017
2
25.0
2
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0
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2
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2.0
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22
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20
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1.96
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2.0
54
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143
18
25
20
36
1.94
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10
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50
0
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41
1.30
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17
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38
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2.0
34
100
0
136
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48
4.7
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1.98
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225
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1.97
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47
2.6
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135
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30
24
1.96
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100
0
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35
25
1.95
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11
2.5
11
100
0
56
21
17
35
25
1.95
30699167--30699280
46
2.5
45
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140
23
21
30
23
1.99
30703339--30703436
29
3.4
29
94
5
166
32
26
12
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30704973--30705082
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17
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0
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46
15
9
29
1.76
30704973--30705081
51
2.1
51
82
0
128
46
14
9
29
1.75
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29
6.0
28
79
11
170
47
17
3
31
1.64
30706038--30706199
81
2.0
79
80
9
175
48
17
3
30
1.65
30706516--30706556
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20.5
2
100
0
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0
0
48
1.00
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0
0
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1.00
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2
15.0
2
93
6
53
48
3
0
48
1.17
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2.2
12
100
0
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0
0
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0.61
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1.9
20
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7
10
7
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1.24
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0
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15
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1.84
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1.9
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5
192
23
27
23
25
2.00
30724785--30724966
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23
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24
2.00
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25
18
30
25
1.98
30731288--30731502
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2.3
90
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25
18
30
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1.98
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16
29
29
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32
14
27
26
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20
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20
100
0
102
17
37
33
11
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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1.93
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1
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0
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19
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1
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1.97
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1.97
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1.98
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1.95
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1.95
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1.96
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0
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0
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11
20
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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143
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5
0
34
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425