Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  305  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
35
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2.4
73
83
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33
23
11
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0
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29
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55
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62
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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24
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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3
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31
26
22
19
1.98
94815156--94815329
47
3.7
47
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5
192
31
27
20
20
1.97
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28
2.3
27
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17
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28
21
21
28
1.99
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15
22
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24
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2.8
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86
0
115
21
23
17
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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55
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3.9
39
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0
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0
0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94950115--94950163
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70
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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