Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6973343--6973404
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93
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93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
6997263--6997438
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
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0
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160
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20
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0
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23
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7015550--7015586
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18
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0
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10
10
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48
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1.98
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47
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29
1.97
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2.4
33
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24
26
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1.98
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2.0
30
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0
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30
28
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22
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9
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1.26
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2.3
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2.0
33
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2
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11
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0
0
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7046516--7046551
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2.2
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0
13
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0
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1.08
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2.0
30
100
0
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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19
100
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0
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1.21
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10
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9
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80
61
2
4
31
1.29
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19
5.2
19
69
11
58
66
2
4
27
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
4
29
1.27
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3
30
1.28
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21
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3
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1.38
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2.5
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15
17
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2.6
239
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22
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24
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3
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2.8
28
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22
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1.22
7085978--7086037
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20
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1
8
20
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7085978--7086037
30
2.0
30
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12
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1
8
20
1.22
7087637--7087668
11
2.8
12
86
13
50
34
0
0
65
0.93
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21
2.7
20
85
2
72
74
9
9
7
1.23
7087915--7087950
18
2.1
17
89
5
54
77
5
5
11
1.10
7089063--7089099
17
2.2
18
85
9
51
29
2
2
64
1.21
7089287--7089352
17
3.9
17
76
20
59
56
0
4
39
1.20
7089283--7089357
17
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16
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20
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57
1
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37
1.26
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18
1.9
18
94
0
61
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40
1.58
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17
2.4
17
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58
0
2
39
1.11
7102468--7102544
41
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40
82
12
95
57
3
3
35
1.36
7102600--7102652
20
2.7
20
82
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1
3
28
1.20
7103122--7103348
86
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85
80
10
210
37
7
15
39
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18
5.0
18
84
0
117
27
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37
1.92
7105793--7105887
36
2.6
36
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0
136
28
16
16
37
1.91
7106747--7106771
11
2.3
11
100
0
50
36
16
28
20
1.93
7110566--7111176
248
2.5
248
90
1
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31
15
18
34
1.92
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93
2.4
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0
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32
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1.89
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60
2.1
60
81
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31
12
20
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1.90
7120630--7120841
93
2.3
93
91
0
334
32
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19
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1.88
7120744--7120881
66
2.1
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156
36
10
21
31
1.88
7123519--7123567
8
6.2
8
81
11
57
12
4
0
83
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7123505--7123567
31
2.0
31
85
11
85
11
9
1
77
1.05
7123505--7123567
30
2.0
32
87
9
94
11
9
1
77
1.05
7135798--7135944
75
2.0
75
82
5
181
20
26
18
34
1.95
7135816--7135944
50
2.6
49
80
7
136
20
27
18
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1.96
7135791--7135944
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24
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20
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3.3
14
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0
2
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0
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0.90
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2.0
21
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0
0
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2.0
33
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23
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1.9
30
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1.95
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20
2.0
20
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23
7
5
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2.0
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0
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14
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14
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9
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8
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12
12
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26
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0
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27
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1.87
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16
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0
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2.0
20
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2
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46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7196919--7197033
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
7196919--7197052
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
7200546--7200598
18
3.3
18
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29
55
22
49
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20
1.74
7200536--7200598
30
2.1
30
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0
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16
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0
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0
12
0
0.55
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2.0
23
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13
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7206185--7206229
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7206398--7207007
147
4.1
148
87
3
781
30
16
19
33
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425