Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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6
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1.51
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2.5
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2.0
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3
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4
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7
0
58
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2.2
21
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0
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31
14
14
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2815385--2815950
133
4.3
132
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4
593
18
13
16
50
1.77
2821098--2821343
102
2.3
106
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279
21
15
37
25
1.93
2821238--2821455
117
1.8
121
81
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279
23
15
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1.94
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24
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0
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22
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1
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18
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0
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2.0
23
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23
2.0
23
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37
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17
4.9
19
82
17
115
38
10
13
36
1.80
2868543--2868597
22
2.6
21
78
13
60
36
7
16
40
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
17
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31
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672
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18
24
25
1.97
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4.9
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213
29
15
28
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1.96
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2.5
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30
15
28
25
1.96
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2.9
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16
28
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1.97
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3.2
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179
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17
35
1.85
2885642--2885751
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2.0
55
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1
184
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0
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2.2
22
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5
83
32
6
3
58
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2913453--2913485
13
2.4
14
95
5
59
39
12
9
39
1.74
2917526--2917566
10
4.0
10
90
3
55
56
4
0
39
1.21
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44
2.0
45
83
2
113
55
3
9
32
1.48
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131
3.5
131
81
5
358
33
18
19
28
1.95
2918373--2918721
129
2.7
130
86
2
425
32
18
19
29
1.96
2919194--2919242
25
2.0
25
84
4
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63
8
0
28
1.23
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25
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15
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66
7
0
26
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19
2.0
20
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100
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30
35
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18
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18
75
16
56
33
3
0
62
1.13
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25
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8
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24
20
31
24
1.98
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20
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18
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10
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0
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47
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13
209
20
20
29
28
1.98
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46
3.7
45
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25
20
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1.98
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1.98
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0
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20
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2.0
22
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0
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58
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11
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11
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0
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1.63
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19
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2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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0
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3
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0
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33
0
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17
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2.0
34
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0
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2.0
17
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0
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25
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26
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1
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2.0
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0
0
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1.00
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0
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0
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2
100
0
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3036968--3037025
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0
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0
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2.0
15
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0
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0
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2
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0
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0
28
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425