Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  385  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118374761--118374865
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40
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0
2
35
1.10
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2.0
25
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25
2.0
25
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62
27
14
4
53
1.60
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4.0
46
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20
24
14
39
1.91
118386671--118386741
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50
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2
70
1.10
118403088--118403134
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4.5
10
75
19
51
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2
2
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1.06
118403088--118403150
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2.0
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2
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5.0
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0
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0
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0.91
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20.5
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0
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0
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2.3
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0
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7
45
1.61
118418602--118418690
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2.4
37
79
1
117
37
10
11
41
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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2.0
35
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86
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1.33
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2.0
22
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4
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1.75
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93
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0
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16
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3
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31
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1.32
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1.44
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2.7
25
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51
26
0
2
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1.12
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28
2.7
28
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2
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1
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2.7
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47
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2.5
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90
0
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59
0
10
29
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59
55
5
3
34
1.42
118453203--118453250
19
2.6
18
86
3
60
54
2
0
43
1.12
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231
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12
36
1.78
118453654--118453693
21
1.9
21
94
0
71
55
12
12
20
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
50
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2.3
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10
12
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1.11
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48
4.6
47
74
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23
27
20
28
1.99
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1.8
96
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2
242
26
27
18
27
1.98
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2.3
54
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26
26
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1.64
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1.98
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1.30
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2.0
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16
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57
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0
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1.9
21
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0
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2
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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2
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0
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4
77
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.98
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2.3
132
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1
528
30
18
25
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118623974--118624194
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24
1.98
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3.9
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1.66
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0
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3.3
25
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10
60
35
23
24
17
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425