Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  394  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120849481--120849527
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2.0
24
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2
12
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13
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1.49
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0
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0
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0
0
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2.0
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69
67
3
1
26
1.16
120860485--120860523
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1.9
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2.0
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10
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3
1
28
1.18
120860556--120860594
21
1.9
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94
5
71
69
5
0
25
1.09
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2.0
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0
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0
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18
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0
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10
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18
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47
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2.3
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155
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19
14
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120898104--120898196
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2.0
47
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0
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0
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100
0
102
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0
0
66
0.92
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9.1
9
81
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60
25
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2.0
23
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60
45
10
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1.65
120909162--120909206
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120910978--120911012
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16
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0
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0
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45
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60
19
0
29
51
1.47
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2.5
126
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0
483
38
15
19
27
1.91
120915500--120915874
129
2.9
128
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2
644
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5
4
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2.5
22
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21
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120916922--120916957
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55
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21
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67
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2.0
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0
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4.2
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16
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23
36
1.94
120922168--120922282
54
2.1
54
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16
23
23
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1.94
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4
0
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22
2.3
23
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3
61
51
11
3
32
1.56
120930213--120930253
17
2.4
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4
29
7
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120939685--120939728
16
2.8
16
82
6
54
15
18
0
65
1.27
120941319--120941415
33
2.8
35
72
20
89
45
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1
51
1.19
120941598--120941630
13
2.5
13
90
0
57
33
27
6
33
1.81
120944122--120944166
19
2.3
20
85
14
60
33
0
6
60
1.23
120944118--120944167
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2.5
20
81
9
59
32
0
8
60
1.26
120944967--120945206
120
2.0
119
88
0
354
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17
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1.92
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2.0
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0
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37
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13
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1.88
120950585--120950612
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120952833--120952932
49
2.0
49
92
3
166
24
19
11
46
1.81
120959490--120959532
21
2.0
21
82
8
52
13
20
16
48
1.80
120962312--120962349
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2.6
15
87
4
51
10
5
0
84
0.77
120962312--120962350
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2.7
14
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11
53
10
5
0
84
0.76
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4.2
26
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0
184
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24
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1.79
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2.1
18
100
0
74
37
16
10
35
1.83
120971314--120971542
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2.0
116
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0
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1.99
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2.00
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1.9
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126
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0
0
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1
7
34
1.38
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16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
121008348--121008390
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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0
0
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0.92
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3
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3
100
0
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0
0
34
0.93
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28
2.7
30
86
9
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53
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5
24
1.64
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12
100
0
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6
0
6
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0.65
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4.9
205
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1
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29
22
18
29
1.97
121018259--121018422
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2.3
73
90
4
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34
20
15
29
1.94
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156
3.3
157
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9
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35
20
16
27
1.94
121018573--121018734
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2.3
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9
211
41
20
14
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2.0
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2.0
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194
2.7
192
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13
24
1.92
121018927--121019102
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2.5
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34
22
14
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1.93
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18
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1.94
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2.6
243
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17
28
1.94
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1.8
93
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19
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453
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19
17
30
1.95
121030486--121030838
149
2.4
148
86
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467
32
19
17
30
1.95
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2.0
49
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20
16
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1.95
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121
2.0
120
94
0
424
33
18
16
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
194
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3.1
71
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2.5
13
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11
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2.5
140
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1.22
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160
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2.5
27
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22
25
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
54
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0
209
35
26
12
24
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425