Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  404  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123391743--123391776
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2.0
17
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0
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0
0
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1
0
49
1.11
123393062--123393102
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2.0
22
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0
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0
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0
0
29
0.87
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0
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0
0
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0
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1
78
0.94
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25
2.7
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20
2
1
75
1.00
123433410--123433474
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28
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66
23
3
1
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1.11
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4
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0
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10
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38
0
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0
0
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1.00
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24
70
5
108
33
31
13
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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100
0
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0
0
50
1.00
123444092--123444248
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24
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5
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33
29
14
23
1.94
123448112--123448983
145
6.0
146
90
2
1315
56
6
7
29
1.53
123448112--123448983
291
3.0
289
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3
1311
56
6
7
29
1.53
123448112--123448983
438
2.0
439
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1
1570
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6
7
29
1.53
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2.6
27
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0
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0
50
16
0
0
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2.2
22
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0
4
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1.9
165
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12
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39
1.68
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18
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0
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2.2
17
90
0
56
18
0
2
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0.87
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2.0
19
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2
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2
94
0
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45
0
2
51
1.15
123467786--123467835
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4.2
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89
0
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44
2
4
50
1.32
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6
6.7
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94
5
53
17
74
0
7
1.05
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2.4
17
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57
19
73
0
7
1.05
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1.9
20
100
0
76
60
5
0
34
1.19
123478933--123478989
22
2.5
23
80
8
62
66
10
7
15
1.42
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3.2
26
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0
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5
22
36
1.79
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2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123498104--123498254
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
123502336--123502700
131
2.8
131
82
4
409
34
17
18
28
1.94
123508703--123508743
20
2.1
19
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55
24
0
2
73
0.96
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16
1.9
16
93
0
53
45
3
25
25
1.69
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2.5
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20
7
14
57
1.61
123509953--123509986
17
1.9
17
94
5
59
23
2
11
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1.43
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21
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1.60
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2.8
16
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15
15
15
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98
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25
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18
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1.74
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2.5
21
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70
36
38
13
11
1.81
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23
2.0
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12.5
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100
0
50
48
0
0
52
1.00
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
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0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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59
2
5
32
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425