Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  202  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61640617--61640735
27
4.4
26
77
11
107
37
19
10
31
1.86
61640716--61641217
27
18.7
27
86
3
647
27
22
9
40
1.85
61641169--61641234
27
2.4
27
76
0
69
31
22
7
37
1.82
61641210--61641281
27
2.7
27
77
0
81
41
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1.80
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3.0
20
92
0
100
35
11
20
32
1.89
61642541--61642683
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
61642541--61642683
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3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
61642541--61642684
71
2.0
72
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4
220
29
22
22
26
1.99
61645721--61645798
25
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26
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10
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1.84
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25
3.1
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8
95
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32
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61645730--61645840
25
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61645732--61645831
51
2.0
51
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125
38
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11
31
1.87
61645823--61646322
27
18.7
27
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27
22
9
40
1.85
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108
5.2
106
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28
22
9
39
1.86
61647445--61647492
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
61647536--61647594
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3.0
20
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0
100
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20
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1.89
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24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
61647645--61647787
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
61647645--61647788
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
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31
2.1
31
84
0
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35
15
23
25
1.94
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2.8
51
83
7
183
30
30
15
23
1.95
61657952--61658104
43
3.6
41
82
6
189
28
22
16
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61657947--61658104
85
1.9
85
85
5
221
29
23
15
31
1.95
61659696--61659899
40
5.3
40
71
11
156
35
25
15
24
1.94
61659666--61659899
112
2.1
108
87
3
333
34
25
15
24
1.95
61660325--61660364
17
2.3
18
83
12
57
22
20
5
52
1.65
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140
1.8
140
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6
353
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17
30
23
1.97
61667521--61667560
17
2.4
17
100
0
80
22
20
10
47
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40
2.8
40
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10
125
37
26
14
21
1.92
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.0
27
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35
20
22
22
1.96
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3.2
54
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3
233
23
20
20
35
1.96
61672769--61672940
81
2.1
81
86
2
238
23
19
20
36
1.95
61672769--61672941
27
6.4
26
83
4
202
23
20
20
35
1.96
61678851--61678902
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
61682331--61682359
15
1.9
15
100
0
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27
13
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1.94
61683524--61683555
15
2.0
17
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11
50
50
37
0
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1.41
61689044--61689093
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6
57
24
10
22
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61689352--61689461
33
3.3
33
90
0
175
28
23
21
26
1.99
61689368--61689474
33
3.4
31
87
6
112
25
25
24
25
2.00
61689601--61689653
26
2.2
24
80
12
63
41
20
20
16
1.90
61689845--61689922
27
2.9
26
79
11
86
21
20
21
35
1.96
61689961--61690101
27
5.2
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78
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33
12
14
39
1.83
61691490--61691642
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61699519--61699671
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
61703803--61703914
40
2.8
40
82
8
138
24
28
24
23
2.00
61705607--61705758
27
5.7
27
78
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125
27
7
21
43
1.79
61705607--61705732
53
2.4
53
79
9
132
27
6
21
44
1.76
61705688--61705774
27
3.3
27
90
1
122
28
11
22
36
1.89
61705765--61705844
27
3.0
26
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5
79
30
21
18
30
1.97
61705794--61705847
27
2.0
27
88
0
81
29
18
20
31
1.96
61710532--61710595
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
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24
7.0
24
93
3
257
26
22
22
28
1.99
61710786--61710953
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2.3
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257
26
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22
29
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11
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20
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31
20
11
37
1.88
61711004--61711062
19
3.0
20
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5
111
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20
10
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1.86
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1.9
25
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69
25
16
25
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1.96
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135
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23
16
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26
22
22
28
1.99
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0
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45
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0
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11
16
1.83
61727892--61727921
15
1.9
16
93
6
53
16
0
3
80
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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78
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29
21
23
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39
3.2
39
91
0
192
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29
21
22
1.99
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39
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39
92
0
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28
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19
1.98
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110
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0
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44
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1.94
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1.96
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1.96
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1.95
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1.99
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1.98
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2.1
19
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25
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6
9.8
6
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3
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77
5
1
15
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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38
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8
11
50
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61882140--61882210
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1
2
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1.31
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4
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0
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23
14
30
31
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425