Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  16  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4366680--4366815
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19
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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25
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34
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0
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23
20
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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2
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4501731--4501765
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0
52
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31
0
28
1.57
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24
2.1
25
92
3
86
29
3
29
37
1.75
4502761--4502811
24
2.1
24
86
13
70
56
9
19
13
1.65
4503094--4503146
3
17.7
3
96
0
97
33
0
0
66
0.92
4503194--4503247
23
2.3
23
77
0
54
27
9
1
61
1.37
4503322--4503385
15
4.1
16
71
16
62
25
7
1
65
1.28
4503334--4503416
30
2.8
30
79
17
84
24
10
2
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1.39
4503482--4503533
25
2.2
23
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28
5
0
65
1.16
4503482--4503534
23
2.3
23
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30
5
0
64
1.17
4504058--4504097
19
2.1
19
100
0
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5
5
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1.44
4504061--4504104
19
2.3
19
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0
70
50
6
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38
1.50
4505243--4505523
106
2.7
105
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2
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31
14
21
32
1.93
4505669--4505846
9
19.4
10
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27
80
33
1
1
64
1.08
4505699--4505823
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27
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13
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32
0
0
65
1.04
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16
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33
0
1
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1.00
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32
1
0
65
1.05
4505710--4505847
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2.2
62
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8
174
31
0
0
66
1.02
4505774--4505857
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27
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32
2
0
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1.05
4510808--4510919
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2.0
56
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3
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44
16
25
14
1.84
4512133--4512191
30
2.0
28
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12
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59
11
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1.56
4516828--4516904
12
6.6
12
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46
32
5
15
1.68
4516850--4516966
4
29.0
4
78
8
94
46
27
4
22
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4524270--4524301
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5.3
6
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0
55
0
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3
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1.17
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24
2.6
24
78
0
70
17
19
30
32
1.95
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30
2.0
30
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6
84
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8
3
32
1.46
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16
2.1
16
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0
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0
0
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1.00
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0
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0
0
50
1.00
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2.0
44
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2
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29
15
6
48
1.71
4539927--4539967
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1.9
22
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14
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56
4
7
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1.48
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2.5
22
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2.1
137
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1
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24
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26
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0
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35
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1.80
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26
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0
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1.79
4544779--4544915
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52
100
0
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24
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1.79
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23
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21
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11
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43
0
3
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0
0
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0
0
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0
0
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7
70
43
0
0
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4547122--4547170
21
2.4
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38
0
0
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0
0
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10
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0
0
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2.1
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11
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39
0
1
59
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4547389--4547446
18
3.2
18
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16
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46
0
5
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1.24
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62
90
0
190
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1.85
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20
2.2
19
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4
50
32
2
0
65
1.06
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18
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18
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8
0
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0
0
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0
0
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1.00
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0
0
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1
0
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3.4
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80
53
2
0
43
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425