Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  218  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66219857--66219900
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18
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1
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3.2
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1.04
66220835--66220890
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21
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3
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0
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1
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1.00
66225860--66225916
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1.00
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0
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0
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3
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1.27
66225985--66226066
30
2.7
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105
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1
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1.33
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30
3.2
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28
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14
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35
0
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2.1
29
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65
2
26
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1.28
66239379--66239423
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35
0
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3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66252651--66252681
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2.1
15
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5
55
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6
6
70
1.29
66252651--66252693
13
3.2
13
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3
50
20
4
6
67
1.33
66252675--66252721
19
2.4
19
89
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67
17
4
6
72
1.22
66252673--66252722
20
2.4
22
80
12
70
18
4
6
72
1.22
66262297--66262371
36
2.1
36
94
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6
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50
1.70
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3.3
30
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26
16
29
1.97
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3.1
11
92
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61
71
8
0
20
1.11
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100
0
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18
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53
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2
7
15
1.15
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11
5.5
10
73
22
55
78
0
17
3
0.88
66265812--66265868
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11.0
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20
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78
0
17
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0.88
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100
0
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2.1
12
100
0
50
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0
16
8
1.02
66265943--66265995
18
2.9
18
80
2
61
67
1
18
11
1.30
66265949--66266029
30
2.7
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101
65
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3.3
30
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90
27
26
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1.97
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14
3.4
14
88
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69
18
29
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45
1.74
66272002--66272047
18
2.4
20
71
14
51
54
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13
26
1.62
66273073--66273129
11
5.5
10
73
22
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77
1
17
3
1.00
66273062--66273129
21
3.2
20
80
12
66
76
2
17
2
1.04
66273073--66273129
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
66273073--66273129
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66275352--66275420
22
3.3
22
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22
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27
36
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24
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2.2
40
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1.93
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3.2
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27
16
27
1.97
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2.8
30
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0
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15
25
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1.96
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30
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11
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17
26
27
1.98
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4.5
20
68
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22
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0
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19
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17
1.90
66285141--66285180
21
1.9
21
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42
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20
20
1.89
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14
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1.45
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6
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90
28
15
27
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66327723--66327754
12
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12
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0
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25
18
12
43
1.85
66327802--66327858
5
11.0
5
75
20
55
1
17
3
77
1.00
66327802--66327858
16
3.7
14
82
15
60
1
17
3
77
1.00
66327802--66327863
21
3.0
21
75
15
58
1
16
4
77
1.02
66328782--66328845
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10
12
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2.9
27
77
10
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13
9
3
73
1.21
66328894--66328945
19
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19
78
0
50
9
11
3
75
1.18
66328861--66328926
30
2.2
29
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7
80
13
10
3
72
1.22
66328900--66328945
10
4.8
10
81
7
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10
10
4
73
1.22
66328862--66328944
30
2.9
27
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16
78
13
9
3
73
1.21
66330915--66330954
19
2.1
19
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0
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22
1.95
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2.7
12
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0
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9
6
9
1.20
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27
15
28
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1.96
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30
2.7
30
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9
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13
21
1
63
1.35
66344655--66344710
18
3.1
18
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7
19
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69
1.27
66344680--66344704
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
66344773--66344829
5
11.0
5
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5
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1
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1.03
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9
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1.20
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11
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6
6
76
1.15
66345759--66345803
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2.0
23
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11
6
8
73
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27
15
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4
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4
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0
70
77
0
0
22
0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66352912--66352945
13
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13
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70
8
8
11
1.34
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27
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0
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0
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27
28
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27
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66371690--66371751
5
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5
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3
17
3
1.07
66371690--66371751
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16
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17
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1.07
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2.1
12
100
0
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0
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28
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0
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29
24
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0
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2.4
27
79
5
69
21
23
18
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66413193--66413244
27
1.9
28
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7
72
17
21
23
38
1.93
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27
3.1
27
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8
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40
1.78
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27
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175
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1.79
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1.79
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27
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0
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28
1.84
66413533--66413784
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1.84
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0
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31
22
8
37
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425