Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  354  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109414353--109414439
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3.3
27
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90
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16
13
33
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109415968--109416006
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4.2
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0
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0
0.55
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8
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24
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25
1.99
109417239--109417421
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4.7
40
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9
225
24
21
28
26
1.99
109424013--109424050
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11
51
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0
13
0
0.56
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77
2.2
78
83
8
212
24
21
29
25
1.99
109425281--109425463
40
4.7
40
82
9
225
24
21
28
26
1.99
109427281--109427317
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2.2
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5
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0
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1.94
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15
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1.95
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4.7
47
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14
31
1.94
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2.5
85
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0
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14
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1.94
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2.8
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180
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1.94
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133
1.8
132
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373
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17
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1.93
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44
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10
160
28
15
24
31
1.95
109442886--109443048
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1.9
83
81
8
193
28
15
24
31
1.95
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2.0
26
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0
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15
9
15
60
1.58
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2.3
43
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52
30
0
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55
1.39
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20
2.3
19
84
12
52
16
4
9
69
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109467141--109467235
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28
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42
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21
17
1.90
109467209--109467269
28
2.2
28
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5
97
44
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16
16
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2.0
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0
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34
2.1
34
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0
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29
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180
26
16
31
25
1.97
109484968--109485127
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
109493403--109493432
15
1.9
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53
53
16
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23
1.66
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2.0
28
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0
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28
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0
0
50
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1.99
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0
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0
0
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23
28
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2.00
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1.9
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17
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2.0
24
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60
46
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8
40
1.54
109515880--109515950
11
6.8
11
69
23
55
42
1
1
54
1.17
109520611--109520662
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2.2
24
82
0
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50
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7
32
1.64
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3
12.3
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100
0
74
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0
0
32
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0
198
47
5
19
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1.71
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2.3
15
90
5
52
54
8
0
37
1.31
109535246--109535361
50
2.3
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78
11
112
51
6
4
37
1.46
109535287--109535394
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2.1
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83
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132
51
7
3
37
1.48
109537606--109537637
3
10.7
3
100
0
64
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109538623--109538670
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2
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47
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2
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1.12
109539123--109539155
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2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
109539202--109539260
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2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
109539231--109539278
26
1.9
24
87
8
69
31
0
4
64
1.12
109544088--109544499
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3.2
129
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5
402
33
16
18
31
1.93
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100
0
76
65
0
0
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2
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0
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1.46
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23
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0
0
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10
36
1.83
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22
23
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22
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1.99
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2.2
164
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0
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0
0
83
0.64
109562056--109562090
5
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5
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17
0
0
82
0.66
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11
7.9
10
78
21
59
8
8
1
82
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.80
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0
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1.97
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109581950--109582110
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1.9
18
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0
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20
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
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232
27
20
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
29
1.98
109651039--109651181
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3.1
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232
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20
30
1.98
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2.0
49
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4
117
27
14
26
31
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425