Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  365  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112543340--112543385
21
2.1
22
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11
60
36
0
2
60
1.09
112543300--112543393
22
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24
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20
76
39
0
2
58
1.10
112543356--112543478
36
3.5
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12
110
40
0
1
56
1.14
112543801--112543851
23
2.3
23
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61
37
1
11
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1.51
112544173--112544205
10
3.4
10
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4
59
45
6
0
48
1.27
112544133--112544195
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2.2
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0
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1.16
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0
45
1.00
112544134--112544241
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2.8
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0
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1
44
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61
56
1
1
41
1.16
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3.8
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1.8
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94
0
306
20
21
29
28
1.98
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29
2.9
29
94
0
139
27
14
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1.95
112559700--112559782
29
2.9
29
94
0
139
27
14
31
26
1.95
112563623--112563753
46
2.8
48
78
14
157
21
19
29
29
1.98
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2.0
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68
64
3
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26
2.0
24
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8
71
63
6
0
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1.19
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2.8
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69
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0
22
1.15
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4.1
30
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0
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29
26
19
24
1.98
112571256--112571303
16
2.8
18
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15
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37
0
0
62
0.95
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22
2.1
21
84
16
56
61
0
2
36
1.09
112571584--112571647
26
2.4
28
79
12
71
46
1
3
48
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112571584--112571649
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2.5
26
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5
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45
1
3
50
1.26
112572126--112572216
23
4.1
22
70
13
62
54
2
0
42
1.12
112572204--112572276
36
2.0
36
84
10
96
68
2
6
21
1.26
112572199--112572250
18
2.9
18
74
5
52
67
1
3
26
1.18
112572255--112572332
38
2.0
39
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2
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75
1
11
11
1.10
112572293--112572322
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3.8
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90
0
51
83
0
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10
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1.9
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0
62
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3
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2.7
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1.34
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2.1
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0
90
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4
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0
12
0
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0
12
0
87
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1
14
0
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0.73
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2.8
16
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13
54
66
0
2
30
1.04
112610764--112610810
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
112610781--112610859
19
4.2
19
88
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117
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11
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36
2.0
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132
35
15
10
38
1.82
112610803--112610840
17
2.5
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12
51
34
15
10
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1.82
112610784--112610869
36
2.4
35
78
14
104
36
13
11
38
1.82
112612231--112612379
52
2.8
52
80
10
169
26
16
27
30
1.96
112612290--112612400
53
2.2
52
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13
128
27
13
27
30
1.94
112612231--112612420
52
3.8
48
75
16
113
25
16
28
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112614056--112614095
2
20.5
2
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50
0
0
50
1.00
112617518--112617556
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7.4
5
94
5
60
23
0
0
76
0.78
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30
3.0
30
77
8
83
30
4
4
60
1.36
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12
2.2
12
100
0
52
34
0
7
57
1.27
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205
2.8
205
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1
956
31
18
21
28
1.97
112633535--112633623
30
3.0
29
75
8
88
29
4
4
61
1.35
112633588--112633613
12
2.2
12
100
0
52
34
0
7
57
1.27
112635233--112635257
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12.5
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100
0
50
48
0
0
52
1.00
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2.3
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129
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18
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100
0
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0
0
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2.4
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158
41
19
18
20
1.90
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12
100
0
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12
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1.70
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25
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230
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0
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100
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0
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20
2.3
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0
4
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7
77
13
58
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39
0
21
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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37
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0
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4
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112686275--112686336
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1.9
175
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46
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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206
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1.04
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14
21
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425