Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  399  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121949310--121949415
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2.2
48
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3
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15
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121949325--121949497
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3
157
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16
26
1.97
121949515--121949663
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4.8
31
89
0
226
26
27
18
26
1.98
121949639--121949767
50
2.5
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2
206
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0
0
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1.00
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2.3
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0
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27
0
0
72
0.85
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10
50
71
0
0
28
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2.1
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28
0
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17
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37
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20
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1.80
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3.5
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91
0
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18
70
18
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12
25
24
37
1.91
122056412--122056551
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3.6
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12
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24
37
1.90
122059604--122059835
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5.0
46
90
1
313
40
14
24
21
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
20
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2.4
16
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33
7
30
28
1.85
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2.1
46
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7
140
34
5
25
35
1.79
122069405--122069530
58
2.2
58
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2
182
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3
0
43
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2.9
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2
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2.0
20
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2.0
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2.0
29
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5
54
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0
0
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12
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2
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7
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1.9
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0
50
1.12
122109462--122109503
13
3.2
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47
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0
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3.7
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1.87
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15
15
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100
0
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0
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19
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4.8
13
79
0
70
33
6
24
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22.0
3
100
0
132
33
0
0
66
0.92
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21
2.2
23
78
17
66
47
0
18
33
1.49
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29
3.4
29
91
1
153
34
11
30
24
1.90
122155264--122155385
33
3.9
32
70
12
83
36
13
18
31
1.89
122155336--122155429
33
2.9
33
84
3
111
40
9
19
30
1.83
122158975--122159289
46
6.8
46
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504
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149
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27
1.92
122160501--122160634
46
3.0
45
82
4
153
35
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2.0
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51
56
5
2
35
1.36
122198290--122198340
23
2.3
22
83
10
59
43
0
1
54
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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5
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0
0
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3.0
29
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53
2
6
37
1.40
122212174--122212230
16
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16
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10
1
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1.44
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6
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2
14
0
84
0.72
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24
2.9
23
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8
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5
14
1
78
1.01
122215223--122215272
23
2.2
23
100
0
100
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0
0
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0
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22
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18
0
0
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21
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24
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0
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1.18
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2
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0
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122249028--122249113
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3
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9
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1.83
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5
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17
30
1.95
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31
20
18
29
1.96
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1.9
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18
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122249739--122251000
408
3.2
397
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1046
34
19
17
28
1.95
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219
27
23
20
28
1.99
122250853--122251018
72
2.3
71
88
4
244
41
21
15
22
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122251018--122251281
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3.7
71
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4
356
37
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14
25
1.92
122251018--122251281
71
3.7
69
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4
339
37
22
14
25
1.92
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257
2.3
257
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2
1042
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14
25
1.93
122258403--122258500
39
2.6
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2.3
15
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0
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5
0
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1.18
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2.3
15
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4
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0
8
2
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0.59
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2.0
20
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0
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24
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0
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0
0
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0
0
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0
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16
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21
6
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2
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18
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6
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3.9
206
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18
22
29
1.97
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2.0
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29
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2.1
24
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27
1
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1.64
122281225--122281390
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3
75
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3
4
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1.30
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6
0
62
1.21
122281630--122281661
16
2.0
16
93
0
55
21
21
6
50
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122281673--122281704
13
2.6
13
90
9
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25
6
3
65
1.31
122281896--122281956
22
2.8
22
80
2
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18
6
6
68
1.33
122281661--122281911
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13
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8
2
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1.42
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0
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0
0
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2.0
25
100
0
100
24
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1.79
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1.41
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0
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0
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1.24
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29
2.0
29
93
0
98
44
10
8
36
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425