Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   

This is table  251  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77038656--77038861
40
5.2
40
82
5
213
25
26
22
26
2.00
77038647--77038861
78
2.7
75
79
10
198
25
26
22
26
2.00
77045858--77046067
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
77053989--77054158
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
77058268--77058346
28
2.8
28
82
0
95
39
12
20
27
1.89
77059374--77059483
43
2.6
42
82
2
148
30
15
23
30
1.95
77060991--77061034
22
2.0
21
83
12
54
27
4
15
52
1.63
77062187--77062216
15
2.0
15
93
0
51
40
16
13
30
1.87
77067731--77067849
46
2.6
45
80
12
118
23
29
19
27
1.98
77074731--77074854
46
2.7
45
76
12
117
22
29
19
29
1.98
77080748--77080788
19
2.1
20
90
4
66
53
12
7
26
1.64
77086053--77086094
21
2.0
22
85
4
59
30
19
14
35
1.91
77087763--77087970
40
5.2
40
82
2
213
25
26
21
25
2.00
77101310--77101404
47
2.0
47
97
0
181
29
16
17
35
1.93
77107652--77107759
42
2.6
42
85
2
137
21
25
33
19
1.97
77108077--77108126
21
2.4
21
77
12
57
38
0
12
50
1.40
77112352--77112430
22
3.6
21
84
5
86
24
20
18
36
1.95
77112363--77112432
22
3.2
21
85
4
95
24
20
18
37
1.94
77114291--77114317
13
2.1
13
100
0
54
44
22
7
25
1.79
77121117--77121217
42
2.4
42
76
11
109
25
30
28
14
1.95
77133188--77133379
40
4.8
39
82
5
163
23
22
28
24
1.99
77133188--77133379
79
2.4
81
83
6
232
23
22
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77133188--77133405
79
2.7
77
80
8
206
24
22
27
25
2.00
77141188--77141378
40
4.8
40
81
8
178
24
23
28
24
1.99
77141188--77141378
79
2.4
80
82
7
221
24
23
28
24
1.99
77141239--77141404
79
2.1
79
80
4
192
24
22
28
25
1.99
77149195--77149384
40
4.8
40
81
8
178
24
23
28
23
1.99
77149195--77149384
79
2.4
80
81
8
212
24
23
28
23
1.99
77157909--77158059
51
3.0
51
86
0
203
26
25
9
39
1.86
77162748--77162915
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
77162748--77162915
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
77170754--77170921
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
77170754--77170921
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
77180571--77180599
14
2.0
15
93
6
51
44
0
0
55
0.99
77181550--77181574
12
2.1
12
100
0
50
40
16
28
16
1.89
77186192--77186231
20
2.0
20
100
0
80
10
20
5
65
1.42
77191182--77191346
43
3.9
43
80
4
165
25
19
29
25
1.98
77202826--77203001
40
4.4
40
89
3
241
26
28
22
23
1.99
77205446--77205531
25
3.5
25
71
15
79
62
9
1
26
1.32
77205427--77205538
49
2.2
50
84
6
145
59
11
2
25
1.45
77205440--77205563
49
2.5
49
78
11
135
58
11
2
28
1.46
77205917--77205946
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
77206313--77206370
30
1.9
30
92
0
98
56
10
3
29
1.49
77206838--77206905
35
2.0
34
82
2
82
44
4
2
48
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77213153--77213309
78
2.0
79
93
1
271
31
15
19
32
1.94
77216541--77216687
73
2.0
73
90
2
233
25
15
23
35
1.94
77233898--77234115
40
5.5
40
94
2
352
25
27
23
23
2.00
77241291--77241508
40
5.5
40
95
2
361
25
27
23
23
2.00
77244659--77244694
18
2.0
18
100
0
72
27
11
11
50
1.72
77249042--77249160
39
3.1
39
86
0
166
43
21
5
29
1.74
77249042--77249114
22
3.5
22
68
25
61
45
19
5
30
1.73
77251481--77251515
17
2.1
17
88
0
52
40
17
5
37
1.73
77252509--77252543
3
11.7
3
100
0
70
34
0
65
0
0.93
77254522--77254569
13
3.7
13
85
0
69
41
29
6
22
1.78
77254519--77254569
26
2.0
26
92
0
84
39
27
5
27
1.79
77263562--77263593
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
77264552--77264663
38
2.9
38
86
4
136
23
23
27
25
2.00
77264568--77264669
38
2.7
38
89
1
143
22
22
26
28
1.99
77264667--77264907
43
5.6
43
97
0
455
9
26
33
30
1.89
77275082--77275289
40
5.2
40
82
4
206
25
26
22
25
2.00
77283169--77283376
40
5.2
40
83
2
222
25
26
22
25
2.00
77289124--77289447
48
6.8
48
84
6
379
25
17
29
27
1.98
77294510--77294535
13
2.0
13
100
0
52
30
0
15
53
1.42
77299667--77299829
40
4.1
40
84
3
220
26
27
22
23
1.99
77307613--77307780
40
4.2
40
85
3
232
26
27
22
23
1.99
77316445--77316537
46
2.0
46
87
4
134
21
25
13
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77318427--77318594
40
4.2
40
79
3
160
23
26
23
27
2.00
77318443--77318592
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
77321726--77321811
43
2.0
43
88
0
127
22
18
31
27
1.97
77327632--77327664
16
2.0
17
88
5
50
24
0
24
51
1.48
77337051--77337176
49
2.6
49
87
5
166
23
28
21
26
1.99
77344421--77344604
79
2.3
81
84
8
236
26
27
21
24
1.99
77344421--77344604
40
4.6
41
82
9
222
26
27
21
24
1.99
77355528--77355681
79
1.9
79
85
2
211
22
20
32
24
1.98
77355528--77355651
39
3.2
39
95
1
212
21
19
33
25
1.97
77362915--77363068
79
1.9
79
85
2
211
22
20
32
24
1.98
77362915--77363038
39
3.2
39
95
1
212
21
19
33
25
1.97
77365814--77365877
33
1.9
33
84
6
85
28
31
15
25
1.96
77367359--77367396
20
1.9
20
88
0
58
34
34
2
28
1.71
77367475--77367589
39
2.8
42
76
12
139
30
25
14
29
1.95
77369554--77369728
93
1.9
94
89
2
271
27
28
21
23
1.99
77374700--77374917
40
5.5
40
86
4
275
26
28
22
22
1.99
77383354--77383417
31
2.1
31
93
0
110
23
23
15
37
1.93
77383611--77383706
24
4.0
24
86
6
133
28
22
20
28
1.99
77383632--77383704
23
3.1
23
94
2
119
28
21
20
28
1.98
77383754--77383820
20
3.3
20
93
0
116
32
20
11
34
1.90
77383754--77383809
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
77383857--77383904
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77391395--77391474
31
2.5
31
90
6
117
22
26
17
33
1.96
77391668--77391784
23
5.0
24
88
8
163
29
22
19
28
1.98
77391689--77391782
45
2.1
46
95
2
172
30
21
19
28
1.97
77391832--77391898
20
3.3
20
93
0
116
32
20
11
34
1.90
77391832--77391887
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
77391935--77391982
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
77393792--77393947
43
3.6
43
78
7
165
32
24
14
28
1.95
77399176--77399220
21
2.2
20
81
11
56
60
0
0
40
0.97
77399469--77399507
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
77402328--77402504
48
3.7
48
89
1
257
34
27
19
18
1.95
77402328--77402504
96
1.8
96
91
2
293
34
27
19
18
1.95
77404261--77404296
16
2.2
17
90
5
56
52
25
5
16
1.65
77405618--77405726
29
3.8
29
80
1
121
26
15
28
29
1.96
77406432--77406471
19
2.1
19
95
0
71
27
2
10
60
1.42
77409585--77409801
76
2.8
77
83
6
242
25
28
21
24
1.99
77409585--77409805
40
5.7
40
85
8
276
25
28
22
24
1.99
77409588--77409805
115
1.9
117
84
7
284
24
27
22
24
2.00
77417623--77417823
77
2.6
78
87
3
262
25
27
20
25
1.99
77417637--77417876
38
6.1
40
83
8
280
25
27
21
25
1.99
77420910--77421213
153
2.0
153
94
0
527
27
21
28
22
1.99
77421359--77421468
29
3.9
28
81
7
116
27
16
28
28
1.97
77433998--77434037
21
1.9
21
84
0
53
37
12
12
37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77445309--77445745
216
2.0
217
95
0
786
30
17
18
33
1.94
77454157--77454299
49
2.9
50
81
5
173
27
21
24
26
1.99
77456283--77456394
48
2.3
47
85
7
145
34
27
17
19
1.95
77458100--77458251
40
3.8
40
85
5
182
23
23
28
25
2.00
77458511--77458557
22
2.1
22
100
0
94
53
0
19
27
1.45
77461166--77461199
17
2.1
16
88
5
50
55
2
2
38
1.30
77463650--77463683
16
2.1
17
88
5
52
32
0
14
52
1.42
77464302--77464335
17
1.9
17
88
5
50
29
14
11
44
1.81
77473098--77473205
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
77474572--77474607
13
2.8
13
95
0
63
27
11
36
25
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425