Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  316  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98374587--98375022
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71
2.8
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294
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20
1.95
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3.1
41
60
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98
32
17
28
21
1.96
98392398--98392561
71
2.3
71
100
0
328
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2.5
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0
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0
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2.6
13
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39
0
12
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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260
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29
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26
1.98
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2.2
144
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308
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29
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27
1.98
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2.8
21
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22
1.98
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1.98
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1.95
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127
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25
17
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98548575--98548694
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1.98
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2.4
49
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0
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20
25
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1.99
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2.0
408
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1462
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21
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98563811--98563973
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1
310
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19
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2.3
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310
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1.95
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1.98
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1.98
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15
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15
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0
84
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17
13
57
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
1.98
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117
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1
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1.96
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59
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1.95
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1.8
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87
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1.94
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1.99
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1.98
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2.0
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22
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
27
93
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33
35
5
25
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98791052--98791106
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21
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21
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1.99
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1.99
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2.00
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8
225
26
26
21
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425