Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  67  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18635528--18635552
13
1.9
13
100
0
50
40
8
0
52
1.31
18635627--18635685
14
4.2
14
80
0
64
33
1
16
47
1.57
18635617--18635685
28
2.4
28
82
2
75
33
1
17
47
1.56
18635619--18635672
21
2.5
22
75
3
56
33
1
16
48
1.57
18649674--18649723
15
3.5
15
69
20
52
50
20
2
28
1.59
18649671--18649730
28
2.1
28
93
0
102
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20
1
26
1.56
18651636--18651694
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1.9
30
89
3
91
30
13
13
42
1.83
18651791--18651825
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3.0
11
88
12
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20
0
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18654273--18654315
17
2.4
18
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3
61
69
2
6
20
1.23
18654280--18654315
18
2.1
17
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5
54
69
2
8
19
1.27
18660266--18660309
19
2.3
19
96
0
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2
0
50
1.13
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67
2.5
68
78
11
157
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26
16
29
1.97
18666897--18667142
40
6.2
40
94
0
422
27
26
21
23
1.99
18669819--18670013
41
4.8
41
89
1
295
40
24
20
14
1.90
18669763--18670013
81
3.1
81
87
2
335
37
22
21
19
1.94
18669988--18670037
24
2.1
24
96
0
91
40
24
26
10
1.86
18670285--18670341
7
8.0
7
76
3
51
24
1
26
47
1.62
18670285--18670344
15
4.1
15
74
8
61
23
1
28
46
1.62
18674555--18674735
78
2.3
80
83
6
226
25
22
27
24
2.00
18674556--18674738
40
4.6
39
79
10
203
25
21
27
25
1.99
18682714--18682894
78
2.3
80
84
6
235
24
22
28
24
1.99
18682715--18682897
40
4.6
39
80
10
212
24
21
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18684705--18684738
3
11.3
3
100
0
68
32
0
35
32
1.58
18688238--18688284
19
2.5
19
76
10
51
21
2
4
72
1.12
18688422--18688569
43
3.4
43
92
0
233
25
21
30
22
1.99
18694046--18694262
40
5.5
40
92
1
339
27
26
21
24
1.99
18699059--18699136
13
5.8
13
75
13
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37
21
1
39
1.62
18699060--18699165
41
2.5
42
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1
151
34
19
1
43
1.62
18699612--18699645
16
2.1
16
89
10
52
58
5
0
35
1.22
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25
1.9
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33
25
16
25
1.96
18703481--18703519
20
2.0
20
94
0
69
35
12
23
28
1.91
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24
5.0
24
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5
170
28
21
22
26
1.99
18703570--18703688
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
18703879--18703942
31
2.1
31
91
2
103
37
15
23
23
1.93
18711448--18711495
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
18711628--18711746
24
5.0
24
92
5
179
30
21
21
26
1.99
18711938--18712001
31
2.1
31
90
0
101
35
15
25
23
1.94
18716543--18716697
43
3.6
43
95
0
265
30
33
23
12
1.92
18716695--18716769
38
2.0
38
89
0
114
32
26
20
21
1.97
18725533--18725588
22
2.5
22
91
0
94
17
32
32
17
1.94
18728168--18728242
39
1.9
39
100
0
150
29
22
5
42
1.75
18728238--18728278
3
13.7
3
94
0
73
2
29
0
68
1.03
18732637--18732856
42
5.1
43
87
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309
22
19
33
24
1.97
18732656--18732856
86
2.4
85
90
3
314
21
20
33
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18732931--18733011
31
2.5
31
80
4
81
61
18
3
16
1.48
18733257--18733302
21
2.2
21
84
0
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2
50
19
28
1.60
18738943--18739177
9
25.6
9
74
9
152
37
0
13
48
1.48
18738972--18739031
17
3.4
17
75
6
66
38
1
10
50
1.46
18738919--18739125
105
2.0
105
84
3
274
38
0
12
47
1.48
18739833--18740969
273
4.0
277
94
4
1860
39
11
12
36
1.79
18744508--18744536
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3
100
0
58
31
0
0
68
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1.41
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2.8
12
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0
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19
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26
1.98
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22
21
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13
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0
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2
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54
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0
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18829948--18830058
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1.9
58
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0
195
35
13
13
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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94
1
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18
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1.92
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13
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25
18
25
30
1.98
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43
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2
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1.94
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28
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22
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1.97
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29
17
24
1.97
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1.95
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1.87
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1.82
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0
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1.94
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1.96
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0
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1.94
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0
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1
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7
100
0
68
58
0
14
26
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
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1.91
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1.97
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1.96
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2.3
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20
54
31
5
5
57
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18999175--18999260
24
3.5
24
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1.98
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2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425