Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  373  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114845702--114846125
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16
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114846144--114846364
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3.0
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30
19
16
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1.93
114845893--114846521
239
2.6
241
92
3
1029
32
18
16
33
1.93
114846383--114846525
74
1.9
74
92
0
241
31
19
16
32
1.94
114846218--114846525
163
1.9
162
85
3
429
32
18
15
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1.93
114854307--114854342
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3.0
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57
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6
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2.8
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0
16
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1.90
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27
2.5
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4
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2.1
23
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0
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2.0
23
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40
1.76
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1.9
52
84
11
134
40
11
17
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1.84
114885450--114885543
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3.6
26
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4
100
38
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18
31
1.86
114886343--114886553
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3.2
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18
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2.1
137
98
0
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31
25
19
24
1.98
114886843--114886894
25
2.0
26
82
10
63
25
15
23
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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114888377--114888486
52
2.1
52
100
0
220
36
24
5
33
1.79
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3.2
64
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20
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29
26
18
26
1.98
114892250--114892535
137
2.1
136
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0
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25
19
24
1.98
114892783--114892835
26
2.0
27
82
7
65
24
15
24
35
1.94
114894314--114894422
26
4.2
26
92
2
184
36
24
5
33
1.79
114894314--114894422
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2.1
52
98
1
211
36
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1.79
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2.1
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1.99
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1.32
114910282--114910401
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134
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100
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0
0
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0
29
43
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29
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41
1.56
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3.1
14
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52
27
0
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27
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2
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1.48
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56
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3
10
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
137
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1.98
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2.0
26
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72
26
13
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1.91
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157
36
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5
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1.79
114940314--114940410
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2.0
49
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1.14
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0
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2
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12
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0
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23
23
0
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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0
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22
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1.9
216
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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A
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0
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38
15
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425