Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  407  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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0
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0
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100
0
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0
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16
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2.2
22
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0
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22
2.5
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2.0
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39
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39
1.67
124197696--124197757
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2.8
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0
0
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0
0
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105
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2.0
17
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3
0
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
0
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0
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2.6
15
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1.94
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73
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17
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1.95
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1.8
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20
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31
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17
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1.96
124260667--124260946
145
1.9
145
82
8
345
31
21
17
29
1.96
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3.0
12
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0
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27
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1.77
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1.9
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57
40
6
28
25
1.79
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3.2
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0
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20.7
3
100
0
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0
0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
124278726--124278771
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1.21
124278840--124278882
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2.4
18
84
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30
11
2
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1.48
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2.2
22
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0
50
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17
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1
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1.09
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29
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22
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50
0
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1.13
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29
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1.10
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13
2.6
13
100
0
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17
0
26
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124308693--124308754
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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4
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30
1.94
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3.1
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6
884
35
18
17
28
1.93
124308525--124309459
253
3.9
243
80
9
761
35
18
16
29
1.93
124309110--124309462
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4.7
75
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421
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18
16
32
1.94
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1.9
119
92
2
394
33
17
16
32
1.92
124309468--124309682
69
2.9
76
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11
250
32
18
16
32
1.94
124309527--124309682
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2.0
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7
197
32
19
16
32
1.94
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1.89
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2.5
140
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1.93
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2.0
124
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13
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1.90
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1.93
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1.45
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6
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0.84
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1.20
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1
0
42
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.43
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2.0
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1.62
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0
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0
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2.0
20
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0
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5
0
35
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124376364--124376417
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2.4
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0
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0
0
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1.89
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1.74
124406693--124406746
24
2.2
24
93
0
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37
33
3
25
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425