Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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0.63
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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134
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1.97
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178
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173
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17
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122
2.0
124
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392
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13
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2.3
257
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18
20
31
1.96
5157675--5158181
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73
75
12
406
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16
19
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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10
47
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5174080--5174238
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3
178
50
13
13
23
1.76
5186807--5186864
30
2.0
29
86
10
82
43
3
15
37
1.64
5190844--5191329
174
2.8
173
85
2
645
44
12
16
26
1.84
5191625--5191682
29
2.0
29
83
10
73
29
10
15
44
1.79
5196833--5196864
6
5.2
6
96
3
55
34
0
3
62
1.11
5198379--5198821
114
3.9
114
91
2
673
32
1
15
51
1.51
5198884--5198946
22
2.9
22
77
15
69
34
0
3
61
1.12
5200959--5201070
33
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33
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19
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25
1.81
5217972--5218004
14
2.3
15
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27
6
15
51
1.66
5223242--5223270
15
2.0
15
93
6
51
48
0
0
51
1.00
5223667--5223697
6
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7
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16
0
0
0.64
5223668--5223697
13
2.3
13
100
0
60
86
13
0
0
0.57
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22
2.0
22
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9
59
39
0
4
56
1.21
5227625--5227677
5
10.0
5
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11
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41
0
1
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1.10
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8
6.6
9
74
22
59
43
0
1
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1.10
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12
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16
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42
0
1
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1.10
5228945--5228986
15
2.9
15
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38
0
11
50
1.40
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5.1
21
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17
22
25
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1.95
5229371--5229466
21
4.5
21
85
2
111
15
21
27
35
1.94
5229358--5229467
42
2.6
42
84
8
150
18
21
25
34
1.96
5231719--5231781
27
2.3
27
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0
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20
26
25
26
1.99
5235405--5235496
33
2.8
32
75
6
85
26
11
45
16
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5237538--5237569
16
2.1
16
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5
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56
6
0
37
1.25
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116
2.3
115
91
4
428
51
14
1
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1.49
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15
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0
6
9
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5.4
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5
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0
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0
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0
0
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2.0
19
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2
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16
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2.0
60
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0
204
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1.9
104
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0
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14
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1.95
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12
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0
6
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0
0
50
1.00
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30
3.1
30
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43
8
0
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1.34
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2
2
17
1.04
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18
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5
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0
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32
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0
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1
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30
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22
21
1.99
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20
2.0
20
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0
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35
2
2
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26
2.0
24
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2.4
24
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0
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119
2.7
119
93
0
535
33
16
19
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5298953--5299220
83
3.2
83
92
1
421
33
18
19
28
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5300876--5300902
2
13.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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2.0
20
84
0
51
35
2
2
58
1.25
5302797--5302839
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11
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50
60
2
0
37
1.10
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2.1
16
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50
58
0
0
41
0.98
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12
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24
0
4
71
1.03
5302985--5303033
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0
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1.03
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2.7
20
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0
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1.07
5302985--5303033
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0
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3.5
11
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16
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71
2
0
25
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425