Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  396  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121276922--121277831
180
5.2
174
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10
779
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16
18
36
1.92
121277371--121277510
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1.9
72
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2
219
31
16
20
31
1.95
121277084--121277749
342
1.9
338
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4
917
28
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121277425--121277831
92
4.5
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407
28
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1.92
121277443--121277923
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448
29
16
18
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1.93
121279755--121279812
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1
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2
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0
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0
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0
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19
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15
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0
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48
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177
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3
15.0
3
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32
0
2
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1.05
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100
0
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0
0
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30
6
0
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1.21
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16
2.0
16
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0
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14
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34
7
1
57
1.35
121299833--121299893
22
2.8
22
80
2
61
18
6
6
68
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121313615--121313984
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5.5
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73
13
256
25
13
23
36
1.92
121313790--121313984
72
2.8
71
89
3
295
23
13
24
39
1.90
121313615--121314132
194
2.7
194
92
0
833
25
13
23
37
1.91
121313861--121314110
122
2.0
126
85
4
339
23
12
22
41
1.88
121313984--121314147
72
2.3
71
85
7
231
22
13
22
41
1.88
121313983--121314503
161
3.3
157
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569
26
16
21
35
1.94
121314305--121314462
73
2.1
74
91
1
255
29
16
20
33
1.95
121315056--121315110
24
2.3
23
75
9
56
40
40
7
12
1.71
121316185--121316231
23
1.9
25
87
12
71
34
2
0
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1.06
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2.6
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79
15
142
36
5
0
57
1.29
121316517--121316631
21
5.2
20
75
15
72
35
6
0
57
1.30
121316529--121316635
21
4.8
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16
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36
4
0
57
1.26
121317762--121317806
17
2.6
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7
56
51
24
0
24
1.49
121319324--121319390
29
2.3
29
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10
44
1.67
121323440--121323659
109
2.0
108
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0
314
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17
28
17
1.93
121325693--121325749
28
2.0
28
93
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98
36
21
7
35
1.80
121330560--121330617
17
3.4
16
74
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53
39
0
10
50
1.37
121330721--121330760
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2.1
19
90
0
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30
12
17
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14
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15
93
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53
23
0
0
76
0.78
121332001--121332072
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3.1
22
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45
0
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50
1.21
121332585--121332665
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13
69
25
61
54
1
1
43
1.16
121332597--121332670
24
3.3
21
80
15
85
52
1
0
45
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121332604--121332674
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3.1
22
82
11
90
54
0
0
45
0.99
121332706--121332744
10
3.7
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86
10
51
82
2
10
5
0.93
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26
3.2
24
80
13
85
31
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4
57
1.44
121338413--121338467
19
3.4
16
76
16
51
30
0
3
65
1.10
121339857--121339899
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2.3
19
95
0
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1.67
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13
2.6
13
80
0
50
38
0
2
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1.13
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19
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63
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0
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1.65
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1.63
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17
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0
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1
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28
1.99
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44
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44
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2.3
180
88
1
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25
21
22
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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4
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
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23
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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213
34
19
18
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425