Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  420  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127576153--127576271
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4.4
27
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0
148
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21
27
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3.4
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3
123
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18
27
1.81
127576715--127576901
27
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27
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137
34
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21
34
1.85
127576716--127576937
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4.1
54
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34
1.87
127576753--127576874
28
4.4
27
77
14
101
31
8
22
37
1.84
127576716--127576937
27
8.1
27
77
7
126
33
9
22
34
1.87
127580825--127580903
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2.5
31
91
0
131
25
24
18
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1.98
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40
2.2
40
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31
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26
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22
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1.99
127581111--127581246
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2.7
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224
26
22
22
28
1.99
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4.3
20
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2
131
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18
9
40
1.82
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5.7
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3
150
31
8
20
39
1.83
127582186--127582336
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2.8
54
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0
167
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21
40
1.82
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21
27
1.79
127582356--127582478
52
2.3
52
83
4
138
43
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17
28
1.81
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1.63
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2.0
41
90
0
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1.81
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2.3
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57
60
2
0
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1.09
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1.9
17
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20
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2.0
41
100
0
166
59
7
16
16
1.59
127607029--127607127
45
2.2
44
79
15
103
52
4
3
40
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
26
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127610725--127610768
21
2.1
21
82
0
52
61
2
2
34
1.21
127611108--127611161
16
3.3
16
97
2
99
42
14
11
31
1.81
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15
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15
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0
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6
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1.50
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23
1
7
67
1.23
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0
23
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0
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50
0
0
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1.00
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0
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265
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18
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35
1.81
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21
2.4
21
76
3
57
68
0
8
24
1.16
127621069--127621115
22
2.1
22
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27
2
6
63
1.30
127621113--127621217
55
1.9
56
80
9
126
33
4
1
60
1.29
127622434--127622472
21
1.9
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41
0
0
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2.1
25
100
0
104
42
15
11
30
1.82
127623523--127623587
26
2.5
26
80
5
69
53
1
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40
1.31
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0
58
24
0
0
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0.80
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1.9
22
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59
51
11
11
25
1.72
127639415--127639462
22
2.1
23
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62
54
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10
20
1.70
127645056--127645166
57
2.0
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94
1
195
34
10
6
48
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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17
2.0
17
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59
12
39
12
36
1.80
127653739--127653801
16
3.9
16
69
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58
39
1
0
58
1.07
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17
2.2
17
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0
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0
10
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1.38
127665752--127665781
15
2.1
15
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53
40
0
0
60
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2.0
25
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8
64
46
0
6
46
1.27
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0
50
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0
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16
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12
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0
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1.24
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76
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1.94
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33
19
16
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1.94
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17
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31
21
17
30
1.96
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1.9
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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T
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Indices
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Size
Copy
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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200
29
6
26
38
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425