Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  362  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111783914--111783946
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2
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0
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0
0
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0
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0
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1
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1.93
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2.8
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2
375
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18
18
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0
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0
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38
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32
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1.83
111810666--111810959
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0
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0
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0
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0
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2
27
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2.0
30
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21
1.86
111828012--111828108
40
2.5
39
77
8
101
29
26
24
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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4.0
8
91
0
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25
25
3
1.67
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3.8
26
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134
17
24
22
35
1.95
111837052--111837161
54
2.0
54
87
3
159
16
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21
38
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82
16
25
22
36
1.94
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4.9
26
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10
142
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24
19
1.96
111846196--111846301
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53
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1
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1.96
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5.9
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11
173
35
21
24
18
1.96
111849279--111849422
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2.7
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35
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23
17
1.95
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2.6
16
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0
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4
23
26
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1.73
111849811--111849854
8
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22
25
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1.70
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20
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20
1.96
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67
2.0
67
100
0
268
28
8
16
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1.77
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2.1
17
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52
30
0
9
60
1.27
111865215--111865317
41
2.5
40
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1
134
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19
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1.62
111866263--111866436
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5.6
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235
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25
25
1.98
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2.0
29
93
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10
31
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32
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2.1
97
79
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215
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22
30
1.90
111874244--111874289
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2.0
23
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51
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49
97
0
183
53
11
11
23
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111878325--111878381
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2.1
27
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107
47
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7
33
1.68
111878722--111878773
15
3.2
15
73
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50
44
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1
53
1.11
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2.0
23
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59
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0
40
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1.9
16
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37
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1.46
111882573--111882937
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2.0
13
100
0
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15
0
0
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1.09
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36
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0
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19
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21
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12
79
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7
5
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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10
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83
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0
12
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
1
0
47
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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112074720--112074826
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1
198
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2
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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