Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  417  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126563854--126563959
54
1.9
54
85
9
144
37
19
15
27
1.92
126563950--126564115
72
2.3
71
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4
235
41
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14
22
1.89
126563990--126564236
122
2.0
124
89
3
383
39
23
13
24
1.90
126564115--126564289
71
2.5
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3
228
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23
14
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1.94
126566205--126566267
28
2.3
27
83
10
74
60
33
3
3
1.28
126568521--126568572
26
2.0
26
82
10
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25
15
21
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126570051--126570186
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5.2
26
92
0
227
37
24
5
33
1.77
126573054--126573099
25
1.9
24
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67
6
26
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1.9
20
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10
60
50
5
0
44
1.24
126587860--126587913
26
2.1
26
89
0
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31
18
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44
1.73
126589471--126589714
125
2.0
119
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4
416
46
7
6
38
1.59
126593205--126593268
28
2.3
27
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2
101
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4
21
39
1.75
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124
3.5
124
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395
37
21
13
27
1.91
126603135--126603637
215
2.3
216
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636
28
12
14
44
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2.0
19
100
0
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1.79
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2.0
90
100
0
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39
16
16
27
1.90
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15
2.9
15
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12
54
46
0
4
48
1.22
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2.4
18
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14
54
72
0
0
27
0.85
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6.7
58
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7
426
10
9
21
58
1.60
126626271--126626362
29
3.1
31
66
23
79
10
10
23
54
1.67
126626270--126626366
33
3.2
33
62
27
77
10
11
22
55
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126630133--126630857
240
3.0
240
98
0
1373
31
12
9
46
1.74
126632741--126632783
20
2.1
20
82
4
50
51
2
4
41
1.35
126634542--126634843
151
2.0
151
92
0
496
34
13
21
30
1.92
126637524--126638083
218
2.6
217
87
0
780
39
21
14
24
1.91
126639481--126639550
34
2.0
35
91
2
115
48
20
10
21
1.78
126644083--126644122
21
2.0
21
85
5
55
67
12
5
15
1.38
126644150--126644197
24
2.0
24
83
4
60
37
20
22
18
1.94
126646064--126646133
30
2.3
30
85
9
90
61
7
4
27
1.41
126647249--126647289
20
2.2
18
86
8
55
7
4
12
75
1.16
126653921--126653958
15
2.6
15
95
4
69
0
28
5
65
1.14
126655631--126655671
21
2.0
21
90
0
64
41
19
2
36
1.65
126657767--126657801
17
2.1
17
100
0
70
45
0
11
42
1.40
126659956--126660016
11
5.2
11
72
20
52
42
1
0
55
1.09
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24
2.0
24
84
7
64
57
0
0
42
0.99
126660055--126660106
23
2.3
23
90
6
79
48
0
1
50
1.12
126667071--126667142
12
6.4
11
72
22
51
47
2
1
48
1.25
126667095--126667130
19
1.9
18
88
5
54
52
2
0
44
1.15
126673990--126674025
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
126674179--126674284
42
2.5
43
79
3
133
36
27
20
15
1.92
126674202--126674274
21
3.4
21
92
3
110
34
30
23
12
1.91
126674179--126674274
21
4.5
22
84
5
108
37
28
20
13
1.91
126674658--126674711
15
3.5
15
87
2
81
51
11
0
37
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126674661--126674719
30
2.0
28
90
6
91
55
10
0
33
1.33
126675686--126675729
19
2.2
19
84
12
52
6
15
4
72
1.22
126675727--126675755
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
126675730--126675757
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2.2
13
100
0
56
53
0
0
46
1.00
126686903--126687024
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2.1
58
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151
29
16
13
40
1.86
126694301--126694384
23
3.2
29
61
25
76
45
7
9
38
1.64
126694301--126694405
50
2.1
50
100
0
210
46
5
9
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1.60
126696659--126696683
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5.0
5
100
0
50
60
0
20
20
1.37
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10
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0
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0
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1.26
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56
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38
1.24
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3.4
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60
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29
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43
0
4
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1.20
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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269
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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1
0
37
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425