Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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0
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2
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1.18
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0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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3.9
39
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39
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37
1.77
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78
1.9
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2.0
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2.0
17
100
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30
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1.8
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19
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2.0
35
81
13
83
58
2
1
37
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
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2.2
18
90
4
62
74
2
0
23
0.94
7672564--7672611
22
2.1
23
85
11
64
72
2
0
25
0.95
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0
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0
0
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10
13
36
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7707653--7707716
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3.6
17
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39
12
12
35
1.81
7707644--7707716
35
2.0
36
94
5
130
38
10
13
36
1.80
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12
2.9
11
87
12
50
35
0
0
64
0.94
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21
5.3
21
66
20
61
36
2
0
59
1.18
7708021--7708051
16
2.0
16
93
6
55
35
0
0
64
0.94
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25
2.8
24
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1
4
57
1.27
7708512--7708576
3
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3
121
33
0
0
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21
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2
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1.59
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100
0
92
67
0
0
32
0.91
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18
2.1
18
100
0
74
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10
5
32
1.60
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15
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15
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45
0
0
54
0.99
7713356--7713421
29
2.3
29
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107
43
0
0
56
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20
3.0
20
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40
0
3
56
1.16
7713691--7713904
9
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9
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10
225
44
21
0
33
1.56
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12
2.2
12
100
0
54
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7
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1.84
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21
2.7
21
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0
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3
1.57
7721532--7721732
43
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43
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1
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1.97
7721532--7721732
86
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323
28
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1.97
7722525--7722586
29
2.1
29
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0
115
32
0
14
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1.41
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7
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100
0
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0
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1.00
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0
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48
5
0
45
1.26
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23
2.5
22
76
13
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11
8
10
69
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
108
22
3
3
70
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34
3.5
34
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2
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22
15
27
34
1.94
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19
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12
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11
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11
3.7
11
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0
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0
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0
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28
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28
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28
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28
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0
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2
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2
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0
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0
0
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2
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31
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15
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1.96
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2.7
43
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31
15
25
27
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8
8.0
7
76
19
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14
1
1
81
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7827255--7827309
21
2.6
22
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16
1
1
80
0.90
7827875--7827909
17
2.1
17
94
0
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17
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1.86
7829721--7829825
3
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3
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4
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1.30
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2.5
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2.2
20
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0
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2.0
23
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4
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2
0
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2.0
102
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1
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23
1.93
7850133--7850286
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2.9
52
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139
36
16
23
23
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425