Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  368  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113343707--113343814
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2.4
44
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3
144
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23
13
33
1.93
113351077--113351184
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
113353189--113353222
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2.5
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0
0
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0.98
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55
2
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2.0
28
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24
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2.1
46
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20
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22
25
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1.99
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154
2.2
154
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0
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22
22
25
29
1.99
113367517--113367851
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8.7
38
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481
22
22
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1.99
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3.0
45
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148
25
21
28
25
1.99
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2.2
18
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20
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2.8
28
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9
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1
1
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1.15
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2.0
106
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2.9
26
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2.2
55
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158
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1.63
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2.0
15
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51
50
0
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10
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10
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4
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31
6
0
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1.20
113422845--113422929
22
4.0
20
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18
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2
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1.03
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2.7
30
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22
2
1
73
1.02
113425571--113425756
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1.9
95
88
6
277
26
15
26
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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2.3
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39
0
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49
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2.6
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41
0
1
56
1.09
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471
1.9
470
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0
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17
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221
26
16
27
29
1.97
113447138--113447288
53
2.8
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214
25
16
27
29
1.97
113448546--113448593
23
2.1
23
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26
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0
0
50
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113463213--113463272
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50
0
0
50
1.00
113463548--113463605
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0
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1.77
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1.9
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14
1.32
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2.1
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28
1.62
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2
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1.64
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17
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25
1.84
113486959--113487042
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9
81
10
102
42
22
9
25
1.83
113487058--113487118
17
3.4
17
70
12
59
50
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31
1.59
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2.0
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100
0
150
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33
1.69
113487049--113487140
37
2.5
37
91
7
134
46
15
5
32
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113489553--113489611
21
2.8
21
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55
3
0
40
1.16
113489562--113489611
21
2.5
20
90
9
77
56
4
0
40
1.18
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21
2.0
22
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35
1.64
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2.0
51
100
0
200
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4
30
1.71
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13
24
1.92
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2.0
149
100
0
608
35
21
8
35
1.84
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11
100
0
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1.35
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56
0
8
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1.30
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2.0
22
95
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25
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44
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53
1.12
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2.1
29
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1.69
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2.4
41
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113
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17
28
29
1.97
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0
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3
38
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113615263--113615308
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23
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2.0
23
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8
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13
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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2.2
30
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2
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30
4
4
60
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
1
41
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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113791512--113791675
80
2.0
80
82
2
195
25
28
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425