Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  282  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87291486--87291580
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23
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0
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2
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19
1.92
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0
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1.93
87336307--87336522
113
1.9
114
95
0
389
17
18
36
28
1.93
87336509--87336632
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2.2
57
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5
171
17
16
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30
1.93
87336511--87336632
57
2.1
58
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7
160
17
16
35
31
1.92
87341551--87341620
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2.3
19
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4
52
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2
11
40
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
2.2
18
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42
0
5
52
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0
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0
0
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1.96
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2.0
23
95
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1.97
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4.9
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31
1.98
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21
30
1.98
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2.0
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1.35
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2.0
187
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16
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2.0
25
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2.1
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100
0
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20
24
1.98
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2.0
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25
18
1.96
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2.3
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21
21
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1.99
87398638--87398706
24
2.7
26
80
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81
34
20
21
23
1.96
87398841--87398937
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2.1
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178
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34
1.77
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30
2.2
30
91
0
107
52
8
1
37
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87401912--87402035
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2.1
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76
30
10
12
46
1.76
87403124--87403188
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2.1
31
94
0
112
26
23
21
29
1.99
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2.7
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13
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7
5
16
70
1.31
87414540--87414577
16
2.4
16
86
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60
55
2
7
34
1.43
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1.9
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20
0
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1.52
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5.6
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90
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21
23
1.99
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2.1
29
100
0
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2.0
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29
1.90
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145
2.1
146
93
2
526
29
29
8
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
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22
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28
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26
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5
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11
25
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1.90
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2.0
55
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3
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18
19
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26
22
2.00
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23
27
23
2.00
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28
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28
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26
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29
1.94
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1
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30
14
24
30
1.95
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0
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28
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22
1.99
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28
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1.98
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1.98
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0
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1.91
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0
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2.3
206
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19
1.95
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2.7
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22
18
1.95
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2.8
137
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2
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24
22
17
1.95
87543342--87543970
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22
18
1.95
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0
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0
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0
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2.4
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83
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0
5
54
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
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143
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21
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24
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1.99
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25
2.2
25
75
3
60
33
8
3
54
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87675194--87675246
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28
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1.34
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2.0
23
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1.50
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27
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1.94
87685496--87685655
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0
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2.0
15
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0
51
40
10
0
50
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425