Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  425  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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1.90
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35
4.6
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201
33
24
10
31
1.90
129280714--129280885
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
129283492--129283690
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26
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216
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4.6
35
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11
23
33
1.90
129329292--129329463
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2.4
75
83
8
205
32
11
23
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
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32
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2.0
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2
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224
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551
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129335425--129335462
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1.9
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2.1
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27
27
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0
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23
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14
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219
3.0
217
89
5
943
24
14
14
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1.81
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2.0
14
100
0
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50
14
0
35
1.43
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42
2.0
42
87
4
121
13
17
24
45
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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571.7
7
97
2
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13
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42
42
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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The End!