Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  201  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61250580--61250883
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2.0
150
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0
545
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30
1.88
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2.0
21
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0
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32
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27
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1.94
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0
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33
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0
0
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25
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20
25
1.99
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1.8
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1.98
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46
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232
28
29
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20
1.98
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3.0
30
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61274030--61274109
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9
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1.8
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20
1.98
61277056--61277231
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3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
61287205--61287330
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2.6
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0
180
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1.85
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47
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30
1.86
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37
2.2
37
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0
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20
22
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24
1.98
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3.0
27
80
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27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
61297781--61297862
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
61306733--61306762
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2.1
14
93
6
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40
13
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8
24
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1.82
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46
2.7
44
84
10
147
31
19
26
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
262
26
20
26
27
1.99
61334037--61334129
5
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5
91
4
154
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0
1
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1.05
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0
0
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0
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0
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30
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1.94
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2.3
58
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28
25
13
32
1.94
61338530--61338581
25
2.1
25
100
0
104
23
28
19
28
1.98
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4.5
30
84
8
162
28
25
13
32
1.94
61344796--61344927
58
2.3
58
84
4
167
28
25
13
32
1.94
61346647--61346686
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2.9
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7
55
62
0
10
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1.27
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29
20
20
1.97
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1.8
93
93
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29
29
20
20
1.98
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2.1
23
100
0
96
52
8
14
25
1.69
61361629--61361689
23
2.7
23
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52
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1.70
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32
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0
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2.0
26
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0
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13
37
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1.90
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23
2.2
24
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31
7
19
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1.80
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0
0
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0
25
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1.9
43
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114
22
19
28
28
1.98
61410897--61411086
53
3.6
53
80
1
193
27
24
11
36
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61426100--61426140
2
21.0
2
95
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0
0
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1.00
61429395--61429423
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14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
61430868--61431151
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6.6
43
88
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344
29
28
16
25
1.97
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33
2.0
33
96
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123
16
24
25
33
1.96
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4.7
40
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218
25
22
26
25
2.00
61441677--61441832
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2.0
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82
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194
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21
26
25
2.00
61451523--61451680
43
3.7
43
81
10
166
24
19
25
29
1.98
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3.2
40
79
2
148
22
29
24
23
1.99
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40
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137
23
26
23
26
2.00
61460134--61460283
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1.9
80
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198
22
26
24
26
2.00
61462303--61462465
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11
161
23
19
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30
1.98
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2.2
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2.2
28
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0
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43
9
24
22
1.83
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20
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1.98
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22
1.99
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80
2.7
79
88
3
309
26
28
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61502222--61502458
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42
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2
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35
21
19
23
1.96
61502230--61502458
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1.8
126
90
1
370
34
21
18
24
1.96
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5
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5
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19
3
1
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0.99
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6
76
9
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16
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1
77
0.99
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16
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15
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17
4
1
77
0.99
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13
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0
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39
1.40
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24
2.00
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1.94
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29
1.98
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1.99
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22
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0
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1.70
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22
20
1.98
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28
29
21
20
1.98
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29
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29
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8
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10
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61559281--61559357
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1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61562297--61562472
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46
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29
21
20
1.98
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27
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0
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28
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53
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1.87
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2.4
54
85
2
159
38
21
9
31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61620787--61620963
81
2.2
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80
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23
9
29
1.87
61620787--61620968
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3.4
54
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5
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23
9
30
1.87
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20
8
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1.84
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27
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0
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1.95
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0
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20
23
1.95
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1.98
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3.2
54
73
6
161
34
19
10
35
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425