Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85508435--85508522
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27
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3
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19
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85508516--85508846
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247
30
7
22
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1.81
85508544--85508846
81
3.8
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281
29
7
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1.81
85514565--85514628
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0
0
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22
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2.0
22
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0
0
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0
0
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1.00
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10
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22
6
6
63
1.43
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22
2.5
22
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20
3
3
72
1.16
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5
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37
0
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1.52
85573455--85573504
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20
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24
0
0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
45
90
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140
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34
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118
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24
2.00
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28
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36
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2
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213
1
0
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49
1.17
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2.1
28
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3
44
1.36
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15
2.7
15
84
0
53
67
2
15
15
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85685967--85686014
7
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7
97
0
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64
0
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1.18
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20
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0
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1.15
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1.99
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21
25
26
1.99
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20
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100
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21
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21
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21
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34
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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7
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22
22
17
1.93
85794038--85794153
54
2.1
54
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3
162
37
22
22
17
1.93
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2
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24
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25
2.00
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22
26
2.00
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22
26
2.00
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1
201
26
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1.92
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1.93
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1.94
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213
33
14
25
26
1.94
85848112--85848271
59
2.8
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0
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24
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80
62
1
3
32
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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224
25
21
26
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
23
26
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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