Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr08 129432109 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  425  ( 50925 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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19
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1.84
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Period
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Percent
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Percent
Indels
Score
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21
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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59
31
1
0
67
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2.0
29
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0
69
33
12
10
43
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42
2.0
42
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0
159
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25
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1.90
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29
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10
15
34
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2.0
60
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19
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28
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2.0
21
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0
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27
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27
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28
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138
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40
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28
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19
2.2
19
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73
0
7
19
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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1.9
18
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40
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0
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25
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9
300
34
20
15
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9833061--9833162
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0
0
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0
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0
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0
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0
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0
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19.8
9
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17
78
29
2
2
65
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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