Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  370  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114114713--114114792
42
1.9
42
89
0
124
16
21
36
26
1.94
114114714--114114802
42
2.1
42
85
0
115
16
17
38
26
1.92
114119661--114119713
22
2.6
19
75
18
52
28
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11
50
1.69
114120220--114120262
22
2.0
23
86
9
63
23
55
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1.62
114121374--114121414
2
21.0
2
90
5
66
46
0
2
51
1.14
114122221--114122701
130
3.7
130
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2
491
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18
18
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2
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2
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0
0
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1.00
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0
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0
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0
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44
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16
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2
7
35
1.44
114151724--114151797
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2.9
26
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11
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1
4
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3.0
18
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13
58
72
0
7
20
1.08
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61
2.0
61
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0
205
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21
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37
2.5
37
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0
170
24
20
27
27
1.99
114152619--114152689
16
4.4
17
75
13
69
32
4
23
39
1.74
114155333--114155388
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2.3
25
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1
0
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1.11
114161363--114161601
49
4.8
49
82
4
300
25
18
25
30
1.98
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14
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66
43
0
0
56
0.99
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32
2.0
32
82
5
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44
13
7
33
1.73
114172994--114173035
22
2.0
22
86
13
61
19
2
0
78
0.86
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2.0
15
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0
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50
0
10
40
1.36
114174520--114174582
27
2.3
26
78
10
72
39
0
9
50
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114186259--114186292
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2.7
12
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13
50
20
2
2
73
1.09
114186259--114186296
14
2.9
13
84
7
51
21
2
2
73
1.07
114194697--114194752
20
2.9
19
76
10
60
76
8
1
12
1.08
114196183--114196211
14
2.1
14
100
0
58
51
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6
34
1.55
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10.1
44
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10
341
34
17
19
28
1.95
114204979--114205433
132
3.4
132
76
9
389
34
17
19
28
1.95
114212535--114212589
20
3.0
18
82
12
67
60
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1
36
1.18
114212535--114212623
8
10.6
8
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17
56
59
4
2
33
1.30
114219136--114219191
27
2.1
27
83
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71
42
0
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13
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2
0
20
0.90
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1760
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7
5
27
1.49
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2.8
25
79
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87
70
4
4
21
1.20
114219542--114220853
285
4.6
285
86
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1790
58
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5
27
1.49
114227155--114227311
78
2.0
78
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0
296
50
12
0
36
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114227313--114227354
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1.9
22
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9
68
2
28
0
69
1.01
114230842--114230925
43
2.0
43
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0
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20
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30
1.84
114231203--114231236
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2.1
17
88
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52
14
58
0
26
1.36
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92
2.0
92
98
0
359
25
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1.91
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2.3
35
91
0
128
41
12
9
36
1.76
114242894--114242970
39
1.9
39
82
12
95
40
0
2
57
1.13
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28
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6
96
20
36
27
16
1.93
114270018--114270052
2
17.5
2
100
0
70
51
0
48
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114280532--114280753
64
3.5
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1
372
40
5
8
45
1.56
114280661--114280689
14
2.1
14
100
0
58
51
6
0
41
1.28
114280725--114280754
14
2.1
14
100
0
60
53
6
0
40
1.27
114282005--114282039
14
2.5
14
85
0
52
42
5
20
31
1.75
114282665--114282714
17
2.9
16
82
14
55
46
0
2
52
1.12
114282834--114282867
12
2.8
12
83
16
52
41
0
5
52
1.25
114282862--114282907
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23.0
2
100
0
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50
0
0
50
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63
0
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0
0.95
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6
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0
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18
18
15
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1.83
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6
4
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1.44
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2.4
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1.76
114299248--114299530
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11.0
18
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6
132
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11
35
1.85
114299329--114299530
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19
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5
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0
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0
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1
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1
0
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0
0
51
1.00
114303502--114303531
10
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11
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41
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Period
Size
Copy
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Percent
Indels
Score
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T
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Period
Size
Copy
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Consensus
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24
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35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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G
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0
36
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425